Universidad de Jaén

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Guía docente 2019-20 - 76712005 - Técnicas de purificación y análisis de proteínas y metabolitos

TITULACIÓN: Máster Univ. en Biotecnología y biomedicina (76712005)
CENTRO: Centro de Estudios de Postgrado de UJA

TITULACIÓN: Doble Máster en Biotecnología y Biomedicina y MFPES (Profesorado) (77912002)
CENTRO: Centro de Estudios de Postgrado de UJA

CURSO ACADÉMICO: 2019-20
GUÍA DOCENTE
1. DATOS BÁSICOS DE LA ASIGNATURA
NOMBRE: Técnicas de purificación y análisis de proteínas y metabolitos
CÓDIGO: 76712005 (*) CURSO ACADÉMICO: 2019-20
TIPO: Obligatoria
Créditos ECTS: 6.0 CURSO: 1 CUATRIMESTRE: PC
WEB: https://www.uja.es/estudios/oferta-academica/masteres/master-universitario-en-biotecnologia-y-biomedicina#informacion-academica
 
2. DATOS BÁSICOS DEL PROFESORADO
NOMBRE: PEDRAJAS CABRERA, JOSÉ RAFAEL
IMPARTE: Teoría - Prácticas [Profesor responsable]
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 060 - BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR
N. DESPACHO: B3 - 302 E-MAIL: pedrajas@ujaen.es TLF: 953212767
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/58291
URL WEB: http://www4.ujaen.es/~pedrajas/
 
NOMBRE: GARCÍA REYES, JUAN FRANCISCO
IMPARTE: Teoría - Prácticas
DEPARTAMENTO: U127 - QUIMÍCA FÍSICA Y ANALÍTICA
ÁREA: 750 - QUÍMICA ANALÍTICA
N. DESPACHO: B3 - B3-114 E-MAIL: jfgreyes@ujaen.es TLF: 953213040
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/24417
URL WEB: http://www4.ujaen.es/~jfgreyes/
 
NOMBRE: MARTÍNEZ LARA, ESTHER DEL PILAR
IMPARTE: Teoría - Prácticas
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 060 - BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR
N. DESPACHO: B3 - 357 E-MAIL: elara@ujaen.es TLF: 953212766
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/57925
URL WEB: https://www.uja.es/investigacion-y-transferencia/grupos-de-investigacion/estres-celular-y-edad
 
NOMBRE: PERAGÓN SÁNCHEZ, JUAN
IMPARTE: Teoría - Prácticas
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 060 - BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR
N. DESPACHO: B3 - 356 E-MAIL: jperagon@ujaen.es TLF: 953212523
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/10954
URL WEB: www4.ujaen.es/~jperagon/
 
NOMBRE: SILES RIVAS, EVA
IMPARTE: Teoría - Prácticas
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 060 - BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR
N. DESPACHO: B3 - B3-364 E-MAIL: esiles@ujaen.es TLF: 953212705
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/53792
URL WEB: https://www.uja.es/investigacion-y-transferencia/grupos-de-investigacion/estres-celular-y-edad
 
NOMBRE: VALDERRAMA RODRÍGUEZ, RAQUEL
IMPARTE: Teoría - Prácticas
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 060 - BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR
N. DESPACHO: B3 - 341 E-MAIL: ravalde@ujaen.es TLF: 953-212768
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/14634
URL WEB: ravalde@ujaen.es
 
3. PRERREQUISITOS, CONTEXTO Y RECOMENDACIONES
PRERREQUISITOS:
-
CONTEXTO DENTRO DE LA TITULACIÓN:

Esta asignatura está ubicada en el Módulo 1: Fundamentos y Técnicas de Biología Molecular, Celular y Genética, en el que se desarrollan los principios básicos y comunes en los que se sustentan los otros módulos de la titulación. Se mostrará una visión amplia y actualizada de la metodología de producción, purificación y análisis de proteínas nativas y recombinantes, de la caracterización de enzimas y determinación de metabolitos y metabolómica.

RECOMENDACIONES Y ADAPTACIONES CURRICULARES:

-

El alumnado que presente necesidades específicas de apoyo educativo, lo ha de notificar personalmente al Servicio de Atención y Ayudas al Estudiante para proceder a realizar, en su caso, la adaptación curricular correspondiente.
4. COMPETENCIAS Y RESULTADOS DE APRENDIZAJE
código Denominación de la competencia
CB10 Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.
CB6 Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación
CB7 Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio
CB8 Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios
CB9 Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades
CE5-1 Saber purificar proteínas recombinantes y procedentes de material biológico nativo
CE5-4 Saber determinar metabolitos
CE5.2 Saber determinar parámetros físico-químicos y cinéticos de proteínas
CE5.3 Conocer técnicas de identificación y cuantificación de proteínas en muestras complejas
CG1 Manejar bibliografía y documentación científica en inglés
CG2 Diseñar y planificar experimentos de investigación
CG3 Ejecutar experimentos de investigación así como interpretar los resultados
CG4 Diseñar estrategias experimentales alternativas
CG5 Organización del laboratorio, control de calidad, riesgos laborales
CG6 Capacidad de crítica y argumentación así como de exposición escrita y oral de proyectos de investigación y sus resultados
CG7 Saber utilizar y sacar el máximo rendimiento de las herramientas bioinformáticas, estadísticas y matemáticas
CT1 Fomentar el respeto a los derechos fundamentales y de igualdad de oportunidades entre hombres y mujeres, los principios de igualdad de oportunidades y accesibilidad universal de las personas con discapacidad y los valores propios de una cultura de paz y valores democráticos.
CT2 Desarrollar espíritu crítico y constructivo, con actitud positiva frente al conocimiento
CT3 Demostrar capacidad de generación de nuevas ideas (creatividad)
CT4 Desarrollar capacidad de trabajo en equipo, de líder, de diálogo, de crítica y autocrítica
CT5 Espíritu innovador y emprendedor
CT6 Motivación por la calidad
CT7 Compromiso ético con personas, organismos públicos y/o privados y con el entorno interno y externo de las organizaciones
Resultados de aprendizaje
Resultado R15 El alumno será capaz de utilizar las principales herramientas experimentales para el aislamiento, identificación y caracterización de proteínas y metabolitos
Resultado R16 El alumno sabrá producir bienes (proteínas recombinantes, etc.) o servicios (diagnóstico) utilizando organismos o productos biológicos
Resultado R17 El alumno sabrá determinar parámetros físico-químicos y cinéticos de enzimas
5. CONTENIDOS

Visión amplia y actualizada de la metodología de producción, purificación, análisis y caracterización de proteínas nativas y recombinantes y de metabolitos
y sus aplicaciones: Preparación de muestras biológicas para purificación de proteínas. Producción masiva de proteínas mediante ADN recombinante.
Estrategias cromatográficas aplicadas a la purificación y caracterización de proteínas nativas y recombinantes. Técnicas de identificación y
cuantificación de proteínas en muestras complejas. Determinación de parámetros físico-químicos y caracterización cinética de enzimas. Técnicas de
determinación de metabolitos: Metabolómica.

-

6. METODOLOGÍA Y ACTIVIDADES
ACTIVIDADES HORAS PRESEN­CIALES HORAS TRABAJO AUTÓ­NOMO TOTAL HORAS CRÉDITOS ECTS COMPETENCIAS (códigos)
A1 - Clases expositivas en gran grupo
  • M2 - Exposición de teoría y ejemplos generales
10.0 0.0 10.0 0.4
  • CB10
  • CB6
  • CB7
  • CB8
  • CB9
  • CE5-1
  • CE5-4
  • CE5.2
  • CE5.3
  • CG1
  • CG2
  • CG3
  • CG4
  • CG5
  • CG6
  • CG7
  • CT1
  • CT2
  • CT3
  • CT4
  • CT5
  • CT6
  • CT7
A2 - Clases en grupos de prácticas
  • M 7 - Prácticas de laboratorio/campo/informática
  • M11 - Resolución de ejercicios
48.0 0.0 48.0 1.92
A21 - Trabajo autónomo del alumno (estudio, lecturas, p.inf., ejerc., etc.) 90.0 0.0 90.0 3.6
A3 - Tutorías colectivas
  • M14 - Foros
2.0 0.0 2.0 0.08
TOTALES: 150.0 0.0 150.0 6.0  
 
INFORMACIÓN DETALLADA:

Clases teóricas en aula impartidas al gran grupo por el profesorado con apoyo de recursos audio-visuales.

Actividades prácticas en laboratorio en pequeño grupo. El alumnado debe elaborar informes de los resultados.

Realización por parte del alumnado de ejercicios y exposición de temas planteados por el profesorado.

El alumnado puede disponer de material de estudio, protocolos experimentales, material bibliográfico, etc. aportado por el profesorado a través de la plataforma Docencia Virtual.

7. SISTEMA DE EVALUACIÓN
 
ASPECTO CRITERIOS INSTRUMENTO PESO
Valoración de la asistencia  Valoración de la asistencia Fichas de control 10.0%
Valoración de la participación  Valoración de la participación Fichas de control 10.0%
Realización de trabajos, casos o ejercicios Valoración de la capacidad de realización de trabajos, casos o ejercicios Trabajos, casos o ejercicios presentados 30.0%
Prácticas de laboratorio/campo/uso de herramientas TIC Valoración de la destreza en la realización de prácticas de laboratorio/informática Fichas de control e informes prácticos 50.0%
El sistema de calificación se regirá por lo establecido en el RD 1125/2003 de 5 de septiembre por el que se establece el sistema europeo de créditos y el sistema de calificaciones en la titulaciones universitarias de carácter oficial
INFORMACIÓN DETALLADA:

Mediante fichas de control, se evaluará la asistencia, interés, espíritu crítico, participación y destreza técnica en las clases expositivas y sesiones prácticas.

El informe de los resultados experimentales de las sesiones de laboratorio y los trabajos o ejercicios propuestos permitirán valorar la destreza técnica, la capacidad de realización de trabajos y de aplicar conocimientos.

8. DOCUMENTACIÓN / BIBLIOGRAFÍA
ESPECÍFICA O BÁSICA:
  • Basic methods in protein: purification and analysis : a laboratory manual . Edición: -. Autor: -. Editorial: Cold Spring Harbor : Cold Spring Harbor Laboratory, 2009  (C. Biblioteca)
  • Protein purification techniques: a practical approach. Edición: 2nd ed. Autor: -. Editorial: Oxford: Oxford University Press, 2001  (C. Biblioteca)
  • Protein purification applications: a practical approach. Edición: 2nd ed. Autor: -. Editorial: Oxford: Oxford University Press, 2001  (C. Biblioteca)
  • Enzyme assays: a practical approach. Edición: -. Autor: -. Editorial: Oxford [etc.]: Oxford University Press Press, 2002  (C. Biblioteca)
  • Molecular and Cellular Enzymology [Recurso electrónico]. Edición: -. Autor: Yon-Kahn, Jeannine. Editorial: Berlin, Heidelberg : Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2010.  (C. Biblioteca)
  • Advances in enzymology and related areas of molecular biology. Volume 76 . Edición: -. Autor: -. Editorial: New York : John Wiley & Sons, 2009  (C. Biblioteca)
  • Metabolómica: nuevo paradigma para el estudio de sistemas biológicos. Edición: -. Autor: Beltrán Carbó, O. Yanes. . Editorial: Boletín GRASEQA 2 (2012) 5-9  (C. Biblioteca)
  • La preparación de la muestra en metabolómica: aspectos clave para la estandarización de los métodos analíticos. Edición: -. Autor: F. Priego Capote. Editorial: Boletín GRASEQA 2 (2012) 10-21.  (C. Biblioteca)
  • Técnicas separativas acopladas a espectrometría de masas (GC-MS, LC-MS y CE-MS) en el ámbito de la Metabolómica. Edición: -. Autor: A. Carrasco Pancorbo, M. Gómez Romero. . Editorial: Boletín GRASEQA 2 (2012) 22-35.  (C. Biblioteca)
  • Guide to protein purification.. Edición: 2ª ed. Autor: -. Editorial: San Diego [etc.] : Academic Press, cop. 2009  (C. Biblioteca)
GENERAL Y COMPLEMENTARIA:
  • The handbook of metabonomics and metabolomics [Recurso electrónico] . Edición: -. Autor: -. Editorial: Amsterdam &#59; Oxford : Elsevier, 2007.  (C. Biblioteca)
  • Metabolomics analysis I. Selection of biological samples and practical aspects preceding sample preparation. Edición: -. Autor: B. Álvarez Sánchez, F. Priego Capote, M.D. Luque de Castro. Editorial: Trends Anal. Chem. 29 (2010) 120-127  (C. Biblioteca)
  • Metabolomics analysis II. Preparation of biological samples prior to detection. Edición: -. Autor: B. Álvarez Sánchez, F. Priego Capote, M.D. Luque de Castro. Editorial: Trends Anal. Chem. 29 (2010)  (C. Biblioteca)
  • Metabolite identification and quantitation in LC-MS/MS-based metabolomics. Edición: -. Autor: J.F. Xiao, B. Zhou, H.W. Ressom. Editorial: Trends Anal. Chem. 32 (2012) 1-14.  (C. Biblioteca)
  • Preparation of urine samples prior to targeted or untargeted metabolomics mass-spectrometry analysis. Edición: -. Autor: -. Editorial: Trends Anal. Chem. 41 (2012) 75-85  (C. Biblioteca)
  • Principles and techniques of biochemistry and molecular biology. Edición: 7th ed. Autor: -. Editorial: New York : Cambridge University Press, 2013  (C. Biblioteca)
9. CRONOGRAMA

https://www.uja.es/estudios/oferta-academica/masteres/master-universitario-en-biotecnologia-y-biomedicina#informacion-academica