Universidad de Jaén

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Guía docente 2019-20 - 75112003 - Nuevas tecnologías en microbiología de alimentos

TITULACIÓN: Máster Univ. en Avances en seguridad de los alimentos (75112003)
CENTRO: Centro de Estudios de Postgrado de UJA

TITULACIÓN: Doble Máster en Avances en seguridad de los alimentos y MFPES (Profesorado) (77712008)
CENTRO: Centro de Estudios de Postgrado de UJA

CURSO ACADÉMICO: 2019-20
GUÍA DOCENTE
1. DATOS BÁSICOS DE LA ASIGNATURA
NOMBRE: Nuevas tecnologías en microbiología de alimentos
CÓDIGO: 75112003 (*) CURSO ACADÉMICO: 2019-20
TIPO: Obligatoria
Créditos ECTS: 6.0 CURSO: 1 CUATRIMESTRE: PC
WEB: http://dv.ujaen.es/docencia/goto_docencia_crs_79339.html
 
2. DATOS BÁSICOS DEL PROFESORADO
NOMBRE: GÁLVEZ DEL POSTIGO RUIZ, ANTONIO MIGUEL
IMPARTE: Teoría [Profesor responsable]
DEPARTAMENTO: U130 - CIENCIAS DE LA SALUD
ÁREA: 630 - MICROBIOLOGÍA
N. DESPACHO: B3 - B3-249 E-MAIL: agalvez@ujaen.es TLF: 953-212160
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/58097
URL WEB: -
 
NOMBRE: GRANDE BURGOS, MARÍA JOSÉ
IMPARTE: Prácticas
DEPARTAMENTO: U130 - CIENCIAS DE LA SALUD
ÁREA: 630 - MICROBIOLOGÍA
N. DESPACHO: B3 - 214 E-MAIL: mjgrande@ujaen.es TLF: 953213378
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/20828
URL WEB: http://www10.ujaen.es/conocenos/departamentos/ciesal/3865
 
NOMBRE: PÉREZ PULIDO, RUBÉN
IMPARTE: Prácticas
DEPARTAMENTO: U130 - CIENCIAS DE LA SALUD
ÁREA: 630 - MICROBIOLOGÍA
N. DESPACHO: B3 - 214 E-MAIL: rppulido@ujaen.es TLF: 953213378
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/5096
URL WEB: http://www10.ujaen.es/conocenos/departamentos/ciesal/3871
 
3. PRERREQUISITOS, CONTEXTO Y RECOMENDACIONES
PRERREQUISITOS:

Conocimientos generales relacionados con Ciencias Experimentales y/o de la Salud

CONTEXTO DENTRO DE LA TITULACIÓN:

La asignatura "Detección y cuantificación de microorganismos en alimentos. Nuevas
tecnologías" permite conocer los métodos estándar de detección y cuantificación de microorganismos
en alimentos, y los avances en biología molecular relacionados con este campo. Esta asignatura proporciona
las bases tanto para la comprensión de otras asignaturas del Master "Avances en Seguridad de los
Alimentos" como para el desarrollo de la futura actividad profesional.

RECOMENDACIONES Y ADAPTACIONES CURRICULARES:

La asignatura es eminentemente práctica y de desarrollo continuo por lo que se recomienda al alumno que tenga disponibilidad para asistir al laboratorio
en todas las sesiones. La docencia será impartida en lengua española. Sin embargo, esta asignatura estará adscrita al programa PATIE de la Universidad
de Jaén por lo que se contará con apoyo específico en inglés y francés para estudiantado extranjero (materiales, tutorización y pruebas de
evaluación).

El alumnado que presente necesidades específicas de apoyo educativo, lo ha de notificar personalmente al Servicio de Atención y Ayudas al Estudiante para proceder a realizar, en su caso, la adaptación curricular correspondiente.
4. COMPETENCIAS Y RESULTADOS DE APRENDIZAJE
código Denominación de la competencia
CB6 Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación
CB7 Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio
CB9 Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades
CE4 Conocimiento avanzado de los diferentes tipos de riesgos (físicos, químicos y biológicos) en la cadena alimentaria.
CE5 Conocimiento avanzado de las tecnologías aplicables en el análisis de alimentos en sus diversas facetas (química y microbiológica), así como los avances tecnológicos más recientes.
CG1 Realizar análisis crítico riguroso de trabajos científicos y bibliografía en inglés sobre seguridad de alimentos.
CG5 Aprender a manejar las herramientas informáticas adecuadas para la extracción, análisis, gestión y representación del conocimiento de las bases de datos que incluyen información relacionada con la seguridad de los alimentos.
CT1 Desarrollar un espíritu crítico en el ámbito científico, que les permita diseñar tareas o proyectos de investigación especializados y avanzar en el conocimiento.
CT2 Saber integrar e interpretar de forma racional los resultados de investigación especializada e integrar los conocimientos generados para obtener las conclusiones correctas.
CT3 Saber aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos. dentro de contextos más amplios.
CT5 Capacidad de elaboración de informes especializados sobre resultados de la investigación realizada, así como su exposición escrita y oral, siendo capaces de comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan- a públicos especializados de un modo claro y sin ambigüedades.
CT6 Capacidad para examinar fuentes especializadas de conocimiento, y adquirir habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo autodirigido o autónomo.
CT7 Desarrollo de destrezas y habilidades avanzadas en el manejo de material y equipos de laboratorio, así como de muestras para análisis.
CT8 Saber utilizar herramientas de información y comunicación específicas que permitan plantear y resolver problemas nuevos dentro de contextos relacionados con estas áreas de estudio.
Resultados de aprendizaje
Resultado R11 Haber adquirido conocimientos avanzados sobre las metodologías moleculares clásicas así como las de última generación para el estudio y la caracterización de los microorganismos en alimentos
Resultado R12 Haber adquirido la capacidad para planificar experimentos basados en técnicas moleculares para la caracterización de microorganismos
Resultado R13 Saber manejar herramientas informáticas para el análisis de material genético aplicadas a la caracterización de microorganismos
5. CONTENIDOS

Técnicas rápidas en microbiología de alimentos. Identificación y tipificación de cepas microbianas mediante técnicas moleculares basadas en el ADN.
Identificación mediante MALDI-TOF. Análisis de secuencias para la identificación de microorganismos. Métodos independientes de cultivo para el estudio
de las comunidades microbianas en alimentos: DGGE, TTGE, y tecnologías basadas en la secuenciación masiva de ADN.

1.- Extracción de ADN bacteriano 

-Extracción de ADN a partir de cultivo puro   

- Extracción de ADN (a partir de colonias) 
- Extracción de ADN a partir de alimentos 
- Determinación de la concentración de ADN 
- Electroforesis de ADN 
- Coloración y visualización del ADN en geles de poliacrilamida

 

2.- Identificación de microorganismos mediante PCR 

- Amplificación del ADN mediante la Reacción en Cadena de la Polimerasa. 
- Identificación de las cepas aisladas mediante secuenciación del ADN 16S. Análisis comparativo de secuencias.


3.- Tipado molecular de cepas microbianas 
- Tipado Molecular de las cepas aisladas mediante la técnica de RAPD (Randomly Amplified Polymorphic 
DNA). Otras técnicas de tipificación. 


4.- Estimación de la diversidad microbiana. Técnicas clásicas y nuevas tecnologías.  
- Extracción de ADN total del alimento a analizar 
- Estrategias basadas en la amplificación de la región hipervariable del ADN 16S mediante PCR 

 

6. METODOLOGÍA Y ACTIVIDADES
ACTIVIDADES HORAS PRESEN­CIALES HORAS TRABAJO AUTÓ­NOMO TOTAL HORAS CRÉDITOS ECTS COMPETENCIAS (códigos)
A1 - Clases expositivas en gran grupo
  • M2 - Exposición de teoría y ejemplos generales
  • M3 - Actividades introductorias
18.0 57.0 75.0 3.0
  • CB6
  • CB7
  • CB9
  • CE4
  • CE5
  • CG1
  • CG5
  • CT1
  • CT2
  • CT3
  • CT5
  • CT6
  • CT7
  • CT8
A2 - Clases en grupos de prácticas
  • M9 - Clases en laboratorio
42.0 33.0 75.0 3.0
  • CB6
  • CB7
  • CB9
  • CE4
  • CE5
  • CG1
  • CG5
  • CT1
  • CT2
  • CT3
  • CT5
  • CT6
  • CT7
TOTALES: 60.0 90.0 150.0 6.0  
 
INFORMACIÓN DETALLADA:
ACTIVIDADES HORAS PRESEN­CIALES HORAS TRABAJO AUTÓ­NOMO TOTAL HORAS CRÉDITOS ECTS COMPETENCIAS (códigos)
A1 - Clases expositivas en gran grupo (Actividad 1)
  • M1 - Clases magistrales
  • M2 - Exposición de teoría y ejemplos generales
  • M3 - Actividades introductorias
24.0 51.0 75.0 3.0
  • CB6
  • CB7
  • CB9
  • CE4
  • CE5
  • CG1
  • CG5
  • CT1
  • CT2
  • CT3
  • CT5
  • CT6
  • CT7
  • CT8
A2 - Clases en grupos de prácticas (Actividad 2)
  • M9 - Clases en laboratorio
  • M7 -Seminarios

 

56.0 19.0 75.0 3.0
  • CB6
  • CB7
  • CB9
  • CE4
  • CE5
  • CG1
  • CG5
  • CT1
  • CT2
  • CT3
  • CT5
  • CT6
  • CT7
TOTALES: 80.0 70.0 150.0 6.0  

 

Asistencia y participación: Se valorará la participación del alumno en la clase, en los debates propuestos tanto individualmente como cuando se requiera en grupos. Durante las clases prácticas se valorará la aportación del alumno, el interés y el desarrollo de las prácticas, el resultado final y la calidad de la actividad presentada. El alumno deberá realizar trabajos individuales en el que se reflejen sus resultados en la parte práctica. Se valorará la estructura del trabajo, la documentación aportada, y el tema elegido.

7. SISTEMA DE EVALUACIÓN
 
ASPECTO CRITERIOS INSTRUMENTO PESO
Asistencia y/o participación en actividades presenciales y/o virtuales Participación activa en la clase. -Participación en los debates -Participación en el trabajo grupal Observación y notas del profesor 85.0%
Realización de trabajos, casos o ejercicios Participación activa en la clase. -Participación en los debates -Participación en el trabajo grupal Observación y notas del profesor 15.0%
El sistema de calificación se regirá por lo establecido en el RD 1125/2003 de 5 de septiembre por el que se establece el sistema europeo de créditos y el sistema de calificaciones en la titulaciones universitarias de carácter oficial
INFORMACIÓN DETALLADA:

 

ASPECTO CRITERIOS INSTRUMENTO PESO
Formación teórica y práctica Asistencia a clases magistrales, sesiones prácticas y seminarios;
participación activa en
el laboratorio y entrega
de cuestionarios y resúmenes.
Se evaluarán las
competencias:
CB6, CB7, CB9, CE4, CE5, CG1, CG5, CT1, CT2, CT3, CT5, CT6, CT7 y CT8.

Control de asistencia

Trabajo en el
laboratorio, revisión
y corrección de los
cuestionarios y resúmenes.

85%
Resolución de
ejercicios
Entrega de 
ejercicios realizados,
razonamiento y
adecuación de los
resultados, aplicación
apropiada de
conocimientos y
recursos utilizados, en
su caso.
Se evaluarán las
competencias:
CB6, CB7, CB9, CE4, CE5, CG1, CG5, CT1, CT2, CT3, CT5, CT6, CT7 y CT8.
Revisión y corrección
de los  ejercicios
entregados
15%

 

 

8. DOCUMENTACIÓN / BIBLIOGRAFÍA
ESPECÍFICA O BÁSICA:
  • Molecular Techniques in the Microbial Ecology of Fermented Foods [Recurso electrónico] . Edición: -. Autor: Cocolin, Luca. Editorial: New York, NY : Springer Science+Business Media, LLC, 2008.  (C. Biblioteca)
  • Brock Biology of Microorganisms. Edición: 12th ed.. Autor: -. Editorial: San Francisco, CA : Pearson Benjamin Cummings, c2009.  (C. Biblioteca)
  • Molecular methods for microbial identification and typing. Edición: -. Autor: Towner, K. J.. Editorial: London [etc.]: Chapman & Hall, 1993  (C. Biblioteca)
  • Molecular Identification, Systematics, and Population Structure of Prokaryotes [Recurso electrónico]. Edición: -. Autor: Stackebrandt, Erko. Editorial: Berlin, Heidelberg : Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 2006.  (C. Biblioteca)
GENERAL Y COMPLEMENTARIA:
  • New high throughput technologies for DNA sequencing and genomics [Recurso electrónico] . Edición: -. Autor: -. Editorial: Amsterdam &#59; Boston : Elsevier, 2007.  (C. Biblioteca)
  • Next generation sequencing : current technologies and applications. Edición: -. Autor: -. Editorial: Norfolk, U.K. : Caister Academic Press, cop. 2014  (C. Biblioteca)
  • Statistical analysis of next generation sequencing data. Edición: -. Autor: -. Editorial: Cham : Springer, 2014  (C. Biblioteca)
  • DNA methods in food safety [Recurso electrónico] : molecular typing of foodborne and waterborne bac. Edición: -. Autor: -. Editorial: -  (C. Biblioteca)
  • Molecular Typing in Bacterial Infections [Recurso electrónico]. Edición: -. Autor: -. Editorial: -  (C. Biblioteca)
9. CRONOGRAMA

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