Universidad de Jaén

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Guía docente 2019-20 - 10213004 - Bioquímica metabólica y molecular

TITULACIÓN: Grado en Biología
CENTRO: FACULTAD DE CIENCIAS EXPERIMENTALES

CURSO ACADÉMICO: 2019-20
GUÍA DOCENTE
1. DATOS BÁSICOS DE LA ASIGNATURA
NOMBRE: Bioquímica metabólica y molecular
CÓDIGO: 10213004 CURSO ACADÉMICO: 2019-20
TIPO: Optativa
Créditos ECTS: 6.0 CURSO: 4 CUATRIMESTRE: PC
WEB: http://dv.ujaen.es/docencia/goto_docencia_crs_351666.html
 
2. DATOS BÁSICOS DEL PROFESORADO
NOMBRE: SILES RIVAS, EVA
IMPARTE: Teoría - Prácticas [Profesor responsable]
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 060 - BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR
N. DESPACHO: B3 - B3-364 E-MAIL: esiles@ujaen.es TLF: 953212705
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/53792
URL WEB: https://www.uja.es/investigacion-y-transferencia/grupos-de-investigacion/estres-celular-y-edad
 
NOMBRE: PERAGÓN SÁNCHEZ, JUAN
IMPARTE: Teoría
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 060 - BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR
N. DESPACHO: B3 - 356 E-MAIL: jperagon@ujaen.es TLF: 953212523
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/10954
URL WEB: www4.ujaen.es/~jperagon/
 
3. PRERREQUISITOS, CONTEXTO Y RECOMENDACIONES
PRERREQUISITOS:
-
CONTEXTO DENTRO DE LA TITULACIÓN:

La Bioquímica Metabólica y Molecular es una asignatura optativa que se encuentra dentro del itinerario Biología Molecular y Clínica. Se estudia una ampliación del metabolismo intermediario, su regulación e integración. Además, se analizan los procesos moleculares implicados en la regulación de la expresión génica y en la dinámica de proteínas. La formación adquirida en esta asignatura servirá de base y complemento a la de otras asignaturas optativas de este itinerario.

RECOMENDACIONES Y ADAPTACIONES CURRICULARES:

Para estudiantes "Erasmus" se suministrará material y bibliografía en inglés. Además, se ofrecerá la posibilidad de realizar tutorías, actividades y pruebas de evaluación en inglés.

El alumnado que presente necesidades específicas de apoyo educativo, lo ha de notificar personalmente al Servicio de Atención y Ayudas al Estudiante para proceder a realizar, en su caso, la adaptación curricular correspondiente.
4. COMPETENCIAS Y RESULTADOS DE APRENDIZAJE
código Denominación de la competencia
CE10 Ser capaz de utilizar aplicaciones informáticas para el estudio de biomoléculas
CE11 Evaluar actividades metabólicas
CE30 Diseñar y aplicar procesos biotecnológicos.
CE41 Ser capaz de utilizar programas informáticos de análisis de secuencias de ácidos nucleicos y proteínas
CG2 Aprender el manejo de las bases de datos y de programas informáticos que pueden emplearse en el ámbito de Ciencias de la Vida
CG7 Utilizar las fuentes de información dentro del ámbito de las Ciencias de la Vida
CT1 Adquirir capacidad de gestión de la información, análisis y síntesis
CT10 Formar profesionales con sólidos valores éticos relacionados con los derechos fundamentales del ser humano, y de modo destacado los relacionados con la igualdad y no discriminación entre seres humanos.
CT2 Adquirir capacidad de organización planificación y trabajo en grupo
CT3 Ser capaz de comunicarse correctamente de forma oral y escrita en la lengua materna
CT4 Conocer una lengua extranjera
CT5 Ser capaz de resolver problemas y aplicar conocimientos teóricos a la práctica
CT6 Desarrollar actitudes críticas basadas en el conocimiento
CT7 Ser capaz de realizar aprendizaje autónomo para el desarrollo continuo profesional
CT8 Ser capaz de adaptarse a nuevas situaciones y de tomar decisiones
CT9 Tener sensibilidad hacia temas de índole social y medioambiental
Resultados de aprendizaje
Resultado 213004A Conoce y comprende los mecanismos moleculares de la transducción de señales
Resultado 213004B Conoce y comprende la regulación del metabolismo glucídico, lipídico y de nucleótidos
Resultado 213004C Conoce y comprende las principales vías del metabolismo de los aminoácidos
Resultado 213004D Conoce y comprende los mecanismos de regulación de la expresión génica
Resultado 213004E Conoce y comprende los procesos de plegamiento, maduración y degradación de proteínas
Resultado 213004F Conoce y comprende los principios, métodos y aplicaciones de la proteómica
Resultado 213004G Es capaz de aplicar técnicas de Bioquímica y Biología Molecular al estudio de la regulación metabólica y dinámica de proteínas
5. CONTENIDOS

Rutas de transducción de señales. Metabolismo glucídico, lipídico y nitrogenado, su regulación e integración. Regulación de la expresión génica en procariotas y eucariotas. Plegamiento, maduración, distribución y degradación de proteínas.

Técnicas y métodos de experimentación del metabolismo y de la Biología Molecular.

PROGRAMA DE TEORÍA DETALLADO

Tema 1.    Introducción. Características generales de las rutas metabólicas. Regulación del metabolismo e integración.

Tema 2.    Sistemas de transducción de señales. Rutas basadas en el AMPc.Rutas basadas en inositol polifosfato, diacilglicerol y calcio. Rutas basadas en receptores con actividad tirosina quinasa. Rutas basadas en el GMPc y óxido nítrico. Rutas de transducción de señales iniciadas por hormonas esteroideas.  

Tema 3.    Metabolismo glucídico, lipídico y nitrogenado, su regulación e integración. Glucólisis y gluconeogénesis. Metabolismo del glucógeno. Ruta de las pentosas fosfato. Digestión, absorción y transporte de lípidos. Síntesis y degradación de ácidos grasos. Cuerpos cetónicos. Biosíntesis de triacilglicéridos y lípidos de membrana. Síntesis y degradación de nucleótidos. Reacciones generales del metabolismo de los aminoácidos y ciclo de la urea.

Tema 4.    Regulación de la expresión génica. Regulación de la expresión génica en procariotas: Operón de la lactosa, operón de la arabinosa y operón del triptófano. Regulación del ciclo vital del fago lambda. ARNs pequeños. Regulación de la expresión génica en eucariotas: Estructura de la cromatina y expresión génica. Modificaciones del ADN. Características generales de los factores de transcripción y de su interacción con el ADN. Mecanismos de regulación post-transcripcional.

Tema 5.    Plegamiento, maduración, distribución y degradación de proteínas. Plegamiento de proteínas en el interior de la célula. Modificaciones post-traduccionales y rutas de distribución de proteínas. Degradación de proteínas: el sistema ubiquitina-proteasoma y la degradación lisosomal.

Tema 6.    Técnicas y métodos de determinación del nivel de expresión de proteínas y genes. Proteómica. Western-blot. Proteómica. Northern-blot, RT-PCR cuantitativa y semicuantitativa, DNA arrays.  

PROGRAMA DE PRÁCTICAS DETALLADO

Efecto del ayuno sobre el comportamiento cinético y niveles de expresión proteica de las deshidrognasas de la ruta de las pentosas fosfato en hígado de rata

Sesión 1 y 2: Determinación de la concentración de glucógeno hepático.

Sesión 3: Preparación de muestras y determinación del comportamiento cinético de la glucosa 6-fosfato deshidrogenasa (G6PDH) y 6-fosfogluconato deshidrogenasa (6PGDH).

Sesión 4 y 5: Determinación del nivel de expresión de la G6PDH mediante Western-blot.

6. METODOLOGÍA Y ACTIVIDADES
ACTIVIDADES HORAS PRESEN­CIALES HORAS TRABAJO AUTÓ­NOMO TOTAL HORAS CRÉDITOS ECTS COMPETENCIAS (códigos)
A1 - Clases expositivas en gran grupo
  • M1 - Clases magistrales
26.0 39.0 65.0 2.6
  • CE11
  • CG7
  • CT1
  • CT10
  • CT2
  • CT3
  • CT4
  • CT5
  • CT6
  • CT7
  • CT8
  • CT9
A2 - Clases en grupos de prácticas
  • M11 - Resolución de ejercicios
  • M6 - Actividades prácticas
  • M7 - Seminarios
  • M8 - Debates
  • M9 - Laboratorios
32.0 48.0 80.0 3.2
  • CE10
  • CE11
  • CE30
  • CE41
  • CG2
  • CG7
  • CT1
  • CT10
  • CT2
  • CT3
  • CT4
  • CT5
  • CT6
  • CT7
  • CT8
  • CT9
A3 - Tutorías colectivas
  • M14 - Supervisión de trabajos dirigidos
  • M15 - Seminarios
  • M17 - Aclaración de dudas
  • M18 - Comentarios de trabajos individuales
2.0 3.0 5.0 0.2
  • CT1
  • CT3
  • CT6
  • CT8
TOTALES: 60.0 90.0 150.0 6.0  
 
INFORMACIÓN DETALLADA:

- Sesiones académicas teóricas (al gran grupo) en las que se desarrollará el programa de teoría propuesto.

- Sesiones de prácticas de laboratorio (al pequeño grupo) en las que el alumnado realizará diferentes técnicas y métodos experimentales. Los resultados obtenidos deberán ser analizados, discutidos y presentados.

- Sesiones de actividades (al pequeño grupo) en las que el alumnado deberá resolver problemas prácticos aplicando los conocimientos adquiridos en las diferentes partes de la asignatura.

- Seminarios con exposición y debate, realizados por grupos de 2 ó 3 personas sobre temas de interés o ampliación del temario.

- Tutorías (individuales y colectivas) en las que el alumnado podrá plantear todas aquellas cuestiones o dudas relacionadas con los aspectos teóricos y prácticos de la asignatura.

7. SISTEMA DE EVALUACIÓN
 
ASPECTO CRITERIOS INSTRUMENTO PESO
Asistencia y/o participación en actividades presenciales y/o virtuales Asistencia y participación Control de asistencia y participación 0.0%
Conceptos teóricos de la materia Valoración de los conocimientos teóricos adquiridos y su aplicación a la resolución de problemas. Nota mínima para considerar la calificación del resto de aspectos: 4 puntos. Pruebas escritas. Se realizarán varias pruebas de evaluación continua (eliminatorias a partir de 5 puntos) y una prueba final. Observación y notas del profesorado. 65.0%
Realización de trabajos, casos o ejercicios Valoración de la estructura, contenidos, recursos utilizados en su elaboración, claridad en la exposición y defensa de la actividad. Valoración por parte del profesorado de la exposición y el material preparado y presentado. Observación y notas del profesorado. 10.0%
Prácticas de laboratorio/campo/uso de herramientas TIC La asistencia a las sesiones prácticas y la entrega de resultados son obligatorias. Se evaluarán la asistencia, y el nivel de aprovechamiento obtenido. Presentación de los resultados y hojas de asistencia.Observación y notas del profesorado. 25.0%
El sistema de calificación se regirá por lo establecido en el RD 1125/2003 de 5 de septiembre por el que se establece el sistema europeo de créditos y el sistema de calificaciones en la titulaciones universitarias de carácter oficial
INFORMACIÓN DETALLADA:

La calificación final de la asignatura se obtendrá al sumar las puntuaciones ponderadas obtenidas en cada aspecto (teoría, seminarios y ejercicios, prácticas) de la asignatura. Si la asignatura no se aprueba en su conjunto en la convocatoria Ordinaria I (enero) se guardará la nota de las partes superadas (teoría, seminarios y ejercicios, prácticas)  para la convocatoria Extraordinaria II (junio-julio) y, en su caso, la extraordinaria I del curso siguiente. Además, en la convocatorias Extraordinaria II y extraordinaria I el alumno tendrá la opción de superar todos los aspectos de la asignatura de tal forma que el sistema de evaluación aplicado será siempre el mismo.

Con cada instrumento se evaluarán las siguientes competencias:

Pruebas escritas: CG7, CT1, CT3, CT5, CT6, CT7, CT8, CE11, CE30.

Observación y notas del profesor para evaluar los seminarios y ejercicios: CG2, CG7, CT1, CT2, CT3, CT4, CT5, CT6, CT7, CT8, CT9, CT10, CE10.

Observación y notas del profesor para evaluar las prácticas de laboratorio: CG2, CG7, CT1, CT2, CT3, CT5, CT6, CT7, CT8, CT9, CT10, CE10, CE11, CE30, CE41.

8. DOCUMENTACIÓN / BIBLIOGRAFÍA
ESPECÍFICA O BÁSICA:
  • LEHNINGER PRINCIPIOS DE BIOQUÍMICA . Edición: 7ª EDICIÓN. Autor: Nelson y Cox. Editorial: Omega  (C. Biblioteca)
  • Fundamentos de bioquímica: la vida a nivel molecular. Edición: 2ª̇ ed.. Autor: Voet, Donald. Editorial: Buenos Aires [etc.]: Médica Panamericana, cop. 2007.  (C. Biblioteca)
  • Textbook of biochemistry : with clinical correlations. Edición: 7 th ed. Autor: -. Editorial: Hoboken, N.J : John Wiley &Sons, Inc. , 2011  (C. Biblioteca)
  • Bioquímica : con aplicaciones clínicas. Edición: 7a ed., reimp. Autor: Berg, Jeremy M. Editorial: Barcelona : Reverté, 2013  (C. Biblioteca)
  • Bioquímica. Edición: 4ª ed. Autor: -. Editorial: Madrid : Pearson Educación, 2013  (C. Biblioteca)
GENERAL Y COMPLEMENTARIA:
  • Biología Molecular de la Celula. Edición: 6ª . Autor: Bruce Alberts. Editorial: Omega  (C. Biblioteca)
  • Bioquímica. Edición: 6ª̇ ed.. Autor: Berg, Jeremy Mark.. Editorial: Barcelona [etc.] : Reverté, 2008  (C. Biblioteca)
  • Principles of biochemistry. Edición: 5th ed. Autor: -. Editorial: Boston : Pearson, c2014  (C. Biblioteca)
  • Biochemistry. The Chemical Reactions of Living Cells.. Edición: 2ª. Autor: Metzler. Editorial: Harcourt Academic Press  (C. Biblioteca)
9. CRONOGRAMA (primer cuatrimestre)
Semana A1 - Clases expositivas en gran grupo A2 - Clases en grupos de prácticas A3 - Tutorías colectivas Trabajo autónomo Observaciones
Nº 1
9 - 15 sept. 2019
3.00.00.0 4.5 Presentación. Temas 1 y 2. 
Nº 2
16 - 22 sept. 2019
3.02.00.0 7.5 Temas 2 y 3. Problemas y seminarios-1. 
Nº 3
23 - 29 sept. 2019
3.00.00.0 4.5 Tema 3.  
Nº 4
30 sept. - 6 oct. 2019
2.06.00.0 12.0 Tema 3. Práctica 1 Problemas y seminarios-2. 
Nº 5
7 - 13 oct. 2019
2.04.00.0 9.0 Tema 3. Práctica 2.  
Nº 6
14 - 20 oct. 2019
1.04.00.0 7.5 Tema 4. Práctica 3  
Nº 7
21 - 27 oct. 2019
2.00.00.0 3.0 Tema 4.  
Nº 8
28 oct. - 3 nov. 2019
2.02.00.0 6.0 Temas 4. Problemas y seminarios-3. 
Nº 9
4 - 10 nov. 2019
0.00.00.0 0.0   
Nº 10
11 - 17 nov. 2019
1.08.00.0 13.5 Tema 4.Prácticas 4 y 5. 
Nº 11
18 - 24 nov. 2019
2.02.00.0 6.0 Tema 5. Problemas y seminarios-4.  
Nº 12
25 nov. - 1 dic. 2019
2.00.02.0 6.0 Tema 5.  
Nº 13
2 - 8 dic. 2019
1.02.00.0 4.5 Temas 5. Problemas y seminarios-5. 
Nº 14
9 - 15 dic. 2019
0.00.00.0 0.0  
Nº 15
16 - 19 dic. 2019
2.02.00.0 6.0 Tema 6. Problemas y seminarios-6. 
Total Horas 26.0 32.0 2.0 90.0