Universidad de Jaén

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Guía docente 2018-19 - 77012008 - Modelización de la distribución potencial de especies y hábitats

TITULACIÓN: Máster Univ. en Análisis, conservación y restauración de componentes físico (77012008)
CENTRO: Centro de Estudios de Postgrado de UJA

TITULACIÓN: Doble Máster en Análisis, conservación y restauración de habitats y MPFES (78012003)
CENTRO: Centro de Estudios de Postgrado de UJA

CURSO ACADÉMICO: 2018-19
GUÍA DOCENTE
1. DATOS BÁSICOS DE LA ASIGNATURA
NOMBRE: Modelización de la distribución potencial de especies y hábitats
CÓDIGO: 77012008 (*) CURSO ACADÉMICO: 2018-19
TIPO: Obligatoria
Créditos ECTS: 4.0 CURSO: 1 CUATRIMESTRE: SC
WEB: http://dv.ujaen.es/docencia/goto_docencia_crs_807251.html
 
2. DATOS BÁSICOS DEL PROFESORADO
NOMBRE: ALCÁNTARA GÁMEZ, JULIO MANUEL
IMPARTE: Teoría [Profesor responsable]
DEPARTAMENTO: U102 - BIOLOGIA ANIMAL, BIOL.VEGETAL Y ECOLOGIA
ÁREA: 220 - ECOLOGÍA
N. DESPACHO: B3 - 165 E-MAIL: jmalcan@ujaen.es TLF: 953212795
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/935
URL WEB: http://www10.ujaen.es/conocenos/departamentos/bioani
 
NOMBRE: MANZANEDA AVILA, ANTONIO JOSE
IMPARTE: Teoría
DEPARTAMENTO: U102 - BIOLOGIA ANIMAL, BIOL.VEGETAL Y ECOLOGIA
ÁREA: 220 - ECOLOGÍA
N. DESPACHO: B3 - - E-MAIL: amavila@ujaen.es TLF: -
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/32154
URL WEB: -
 
3. PRERREQUISITOS, CONTEXTO Y RECOMENDACIONES
PRERREQUISITOS:

-

CONTEXTO DENTRO DE LA TITULACIÓN:

.

RECOMENDACIONES Y ADAPTACIONES CURRICULARES:
-
El alumnado que presente necesidades específicas de apoyo educativo, lo ha de notificar personalmente al Servicio de Atención y Ayudas al Estudiante para proceder a realizar, en su caso, la adaptación curricular correspondiente.
4. COMPETENCIAS Y RESULTADOS DE APRENDIZAJE
código Denominación de la competencia
CB10 Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.
CB6 Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación
CB7 Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio
CB8 Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios
CB9 Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades
CT3 Conocer y aplicar las herramientas para la búsqueda activa de empleo y el desarrollo de proyectos de emprendimiento.
CT4 Desarrollar las aptitudes para el trabajo cooperativo y la participación en equipos, las habilidades de negociación e incorporar los valores de cooperación, esfuerzo, respeto y compromiso con la búsqueda de la calidad como signo de identidad.
CT5 Analizar, razonar críticamente, pensar con creatividad y evaluar el propio proceso de aprendizaje discutiendo asertiva y estructuradamente las ideas propias y ajenas.
E03MHABI Conocer, manejar e integrar técnicas de adquisición, tratamiento y explotación de datos geoespaciales, en especial los Sistemas de Información Geográfica, como herramientas de análisis y modelización de datos y de producción de cartografías temáticas específicas.
E15MHA Aplicar la distribución de especies y hábitats en programas de conservación de especies y hábitats, estudios epidemiológicos, estudios de efectos del cambio climático, diseño de áreas protegidas, estudios de impacto de actividades humanas en el medio natural o el manejo de especies invasoras.
G01MHAB Conocer y utilizar las TICs en el campo de la gestión del hábitat y el medio ambiente.
G02MHAB Conocer y aplicar la normativa y regulación local, autonómica y nacional en el ámbito de la gestión del hábitat y el medioambiente.
G03MHABI Comprender y ser capaz de aplicar las herramientas de investigación en el ámbito del estudio del hábitat y el medio ambiente
Resultados de aprendizaje
Resultado RB10 Ser capaces de asumir la responsabilidad de su propio desarrollo profesional y de su especialización en uno o más campos de estudio.
Resultado RB6 Haber adquirido conocimientos avanzados y demostrado, en un contexto de investigación científica y tecnológica o altamente especializado, una comprensión detallada y fundamentada de los aspectos teóricos y prácticos y de la metodología de trabajo en uno o más campos de estudio.
Resultado RB7 Saber aplicar e integrar sus conocimientos, la comprensión de estos, su fundamentación científica y sus capacidades de resolución de problemas en entornos nuevos y definidos de forma imprecisa, incluyendo contextos de carácter multidisciplinar tanto investigadores como profesionales altamente especializados.
Resultado RB7b Ser capaces de predecir y controlar la evolución de situaciones complejas mediante el desarrollo de nuevas e innovadoras metodologías de trabajo adaptadas al ámbito científico/investigador, tecnológico o profesional concreto, en general multidisciplinar, en el que se desarrolle su actividad.
Resultado RB7c Haber desarrollado la autonomía suficiente para participar en proyectos de investigación y colaboraciones científicas o tecnológicas dentro su ámbito temático, en contextos interdisciplinares y, en su caso, con una alta componente de transferencia del conocimiento.
Resultado RB8 Saber evaluar y seleccionar la teoría científica adecuada y la metodología precisa de sus campos de estudio para formular juicios a partir de información incompleta o limitada incluyendo, cuando sea preciso y pertinente, una reflexión sobre la responsabilidad social o ética ligada a la solución que se proponga en cada caso
Resultado RB9 Saber transmitir de un modo claro y sin ambigüedades a un público especializado o no, resultados procedentes de la investigación científica y tecnológica o del ámbito de la innovación más avanzada, así como los fundamentos más relevantes sobre los que se sustentan
Resultado RE03mHA Demuestra conocimiento y es capaz de manejar e integrar técnicas de adquisición, tratamiento y explotación de datos geoespaciales, en especial los Sistemas de Información Geográfica, como herramientas de análisis y modelización de datos y de producción de cartografías temáticas específicas.
Resultado RE15mHA Aplica la distribución de especies y hábitats en programas de conservación de especies y hábitats, estudios epidemiológicos, estudios de efectos del cambio climático, diseño de áreas protegidas, estudios de impacto de actividades humanas en el medio natural o el manejo de especies invasoras.
Resultado RG01mHA Demuestra que conoce y es capaz de utilizar las TIC en la gestión del hábitat y el medioambiente
Resultado RG03mHA Demuestra que conoce y aplica las herramientas básicas de investigación en el ámbito de estudio del hábitat y del medioambiente.
Resultado RG04mHA Demuestra que conoce y es capaz de analizar y evaluar teorías, resultados y desarrollos en el idioma de referencia, además de en la lengua materna, en el ámbito del estudio del hábitat y el medioambiente.
Resultado RT3 Conoce y aplica las herramientas para la búsqueda activa de empleo y el desarrollo de proyectos de emprendimiento.
Resultado RT4 Demuestra habilidades para el trabajo cooperativo, la participación en equipos y la negociación, incorporando los valores de cooperación, esfuerzo, respecto y compromiso con la búsqueda de la calidad como signo de identidad.
Resultado RT5 Analiza y razona críticamente, discutiendo asertiva y estructuradamente las ideas propias y ajenas, demostrando pensamiento creativo y capacidad para evaluar el propio proceso de aprendizaje.
5. CONTENIDOS

Conocer las áreas de distribución (actual/real y potencial) de especies es una herramienta básica para su manejo, especialmente en el ámbito de la conservación. En este contexto, la asignatura se estructura en bloques temáticos dedicados a: generación, obtención y preparación de información georreferenciada sobre distribución de especies; herramientas analíticas para la generación de modelos de distribución o adecuación del hábitat, mé- todos de validación de modelos y presentación de resultados en formato cartográfico.

El objetivo general de la asignatura es lograr que los alumnos entiendan los procedimientos y métodos de elaboración de un modelo de distribución de especies o hábitats (SDM por sus siglas en inglés) y que en última instancia sean capaces de elaborar un SDM para abordar problemáticas asociadas a la distribución geográfica de una especie (p. ej.: reintroducción de especies, cambios de distribución en relación al cambio climático, posibles rutas expansión de plagas, enfermedades o especies invasoras).

La asignatura comenzará con una sesión de presentación e introducción general de los contenidos teóricos y prácticos. Además, en esta primera sesión se realizará la asignación de trabajos de prácticas.

Los contenidos teórico/prácticos se estructuran en cuatro bloques. En el primer bloque se abordarán las fuentes y métodos de obtención de información georreferenciada, así como su procesado y preparación para su uso final en la generación de un SDM.

En el segundo bloque, el de mayor duración, se expondrán las bases teóricas, asunciones y condiciones necesarias para la aplicación de distintos modelos/algoritmos para la creación de SDMs (p. ej.: Bioclim, DOMAIN, Mahalanobis, GLM, MaxEnt, CART). Cada alumno aplicará varios de estos modelos al problema que vaya a abordar en su trabajo de prácticas.

En el tercer bloque se revisarán las distintas técnicas de valoración de la fiabilidad de los SDMs (p. eje.: matriz de confusión, k-fold, jacknife, AUC, TSS).

El cuarto y último bloque se dedicará a la generación de resultados del SDM en formato cartográfico, breve discusión de los resultados y elaboración de conclusiones, siguiendo el formato de un informe técnico.

6. METODOLOGÍA Y ACTIVIDADES
ACTIVIDADES HORAS PRESEN­CIALES HORAS TRABAJO AUTÓ­NOMO TOTAL HORAS CRÉDITOS ECTS COMPETENCIAS (códigos)
A1 - Clases expositivas en gran grupo
  • M 32 - Conferencia plenaria, sesión magistral
20.0 0.0 20.0 0.8
  • CB10
  • CB6
  • CB7
  • CB8
  • CB9
  • CT3
  • CT4
  • CT5
  • E03MHABI
  • E15MHA
  • G01MHAB
  • G02MHAB
  • G03MHABI
A21 - Trabajo autónomo del alumno (estudio, lecturas, p.inf., ejerc., etc.)
  • M13 - Otras actividades
0.0 60.0 60.0 2.4
  • CB6
A2a - Actividades en pequeño grupo
  • M2a - Docencia en pequeño grupo: seminarios, debates, actividades prácticas y aclaración de dudas
20.0 0.0 20.0 0.8
  • G03MHABI
TOTALES: 40.0 60.0 100.0 4.0  
 
INFORMACIÓN DETALLADA:

Al tratarse de una asignatura metodológica, los contenidos teóricos y prácticos se impartirán de forma conjunta, de manera que cada sesión práctica irá precedida de una sesión de una o dos horas en la que se expondrán los contenidos teóricos que se vayan a necesitar. Todas las sesiones (tanto teóricas como prácticas) se desarrollarán íntegramente en aulas de informática.

Al inicio del curso cada alumno deberán elegir un problema relacionado con la distribución de especies o hábitats, para abordarlo mediante la elaboración de SDMs. Al final de la asignatura cada alumno deberá realizar una presentación de sus resultados (presentación de 10 min. más 5 min. para preguntas). Para ello, la asignatura se ha estructurado de modo que en las sesiones de prácticas los alumnos lleven a cabo cada paso para la elaboración del SDM (todos con el mismo caso de ejemplo) y posteriormente lo apliquen a sus propios casos problema durante sus horas de trabajo autónomo. 

7. SISTEMA DE EVALUACIÓN
 
ASPECTO CRITERIOS INSTRUMENTO PESO
Conceptos teóricos de la materia Examen sobre los conceptos teóricos y prácticos de la materia - 50.0%
Realización de trabajos, casos o ejercicios Realización de trabajos, casos o ejercicios prácticos - 50.0%
El sistema de calificación se regirá por lo establecido en el RD 1125/2003 de 5 de septiembre por el que se establece el sistema europeo de créditos y el sistema de calificaciones en la titulaciones universitarias de carácter oficial
INFORMACIÓN DETALLADA:

La evaluación se realizará mediante un examen final acerca de los contenidos teóricos y la realización y exposición de un trabajo de prácticas individual (en formato de informe técnico).

8. DOCUMENTACIÓN / BIBLIOGRAFÍA
ESPECÍFICA O BÁSICA:
  • Mapping Species Distributions: Spatial Inference and Prediction. Cambridge University Press. Edición: -. Autor: Franklin, J.. Editorial: Cambridge University Press  (C. Biblioteca)
  • Mapping Species Distributions: Spatial Inference and Prediction. Cambridge University Press. Edición: -. Autor: Franklin, J.. Editorial: Cambridge University Press  (C. Biblioteca)
  • Mapping Species Distributions: Spatial Inference and Prediction. Cambridge University Press. Edición: -. Autor: Franklin, J.. Editorial: Cambridge University Press  (C. Biblioteca)
  • Mapping Species Distributions: Spatial Inference and Prediction. Cambridge University Press. Edición: -. Autor: Franklin, J.. Editorial: Cambridge University Press  (C. Biblioteca)
  • Mapping Species Distributions: Spatial Inference and Prediction. Cambridge University Press. Edición: -. Autor: Franklin, J.. Editorial: Cambridge University Press  (C. Biblioteca)
  • Mapping Species Distributions: Spatial Inference and Prediction. Cambridge University Press. Edición: -. Autor: Franklin, J.. Editorial: Cambridge University Press  (C. Biblioteca)
  • Mapping Species Distributions: Spatial Inference and Prediction. Cambridge University Press. Edición: -. Autor: Franklin, J.. Editorial: Cambridge University Press  (C. Biblioteca)
GENERAL Y COMPLEMENTARIA:
  • Ecological Modelling. Edición: -. Autor: Austin, M. P.. Editorial: Elsevier.
    • Observaciones: Artículo: Austin, M. P. 2002. Spatial prediction of species distribution: an interface between ecological theory and statistical modelling. Ecological Modelling 157: 101-18
     (C. Biblioteca)
  • Annual Review of Ecology and Systematics . Edición: -. Autor: Elith, J. and J.R. Leathwick. Editorial: Annual Reviews.
    • Observaciones: Artículo: Elith, J. and J.R. Leathwick, 2009. Species Distribution Models: Ecological Explanation and Prediction Across Space and Time. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 40: 677-697.
     (C. Biblioteca)
  • Ecological Modelling. Edición: -. Autor: Austin, M. P.. Editorial: Elsevier.
    • Observaciones: Artículo: Austin, M. P. 2002. Spatial prediction of species distribution: an interface between ecological theory and statistical modelling. Ecological Modelling 157: 101-18
     (C. Biblioteca)
  • Ecological Modelling. Edición: -. Autor: Austin, M. P.. Editorial: Elsevier.
    • Observaciones: Artículo: Austin, M. P. 2002. Spatial prediction of species distribution: an interface between ecological theory and statistical modelling. Ecological Modelling 157: 101-18
     (C. Biblioteca)
  • Annual Review of Ecology and Systematics . Edición: -. Autor: Elith, J. and J.R. Leathwick. Editorial: Annual Reviews.
    • Observaciones: Artículo: Elith, J. and J.R. Leathwick, 2009. Species Distribution Models: Ecological Explanation and Prediction Across Space and Time. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 40: 677-697.
  • Ecological Modelling. Edición: -. Autor: Austin, M. P.. Editorial: Elsevier.
    • Observaciones: Artículo: Austin, M. P. 2002. Spatial prediction of species distribution: an interface between ecological theory and statistical modelling. Ecological Modelling 157: 101-18
     (C. Biblioteca)
  • Annual Review of Ecology and Systematics . Edición: -. Autor: Elith, J. and J.R. Leathwick. Editorial: Annual Reviews.
    • Observaciones: Artículo: Elith, J. and J.R. Leathwick, 2009. Species Distribution Models: Ecological Explanation and Prediction Across Space and Time. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 40: 677-697.
  • Annual Review of Ecology and Systematics . Edición: -. Autor: Elith, J. and J.R. Leathwick. Editorial: Annual Reviews.
    • Observaciones: Artículo: Elith, J. and J.R. Leathwick, 2009. Species Distribution Models: Ecological Explanation and Prediction Across Space and Time. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 40: 677-697.
  • Ecological Modelling. Edición: -. Autor: Austin, M. P.. Editorial: Elsevier.
    • Observaciones: Artículo: Austin, M. P. 2002. Spatial prediction of species distribution: an interface between ecological theory and statistical modelling. Ecological Modelling 157: 101-18
     (C. Biblioteca)
  • Annual Review of Ecology and Systematics . Edición: -. Autor: Elith, J. and J.R. Leathwick. Editorial: Annual Reviews.
    • Observaciones: Artículo: Elith, J. and J.R. Leathwick, 2009. Species Distribution Models: Ecological Explanation and Prediction Across Space and Time. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 40: 677-697.
  • Ecological Modelling. Edición: -. Autor: Austin, M. P.. Editorial: Elsevier.
    • Observaciones: Artículo: Austin, M. P. 2002. Spatial prediction of species distribution: an interface between ecological theory and statistical modelling. Ecological Modelling 157: 101-18
  • Annual Review of Ecology and Systematics . Edición: -. Autor: Elith, J. and J.R. Leathwick. Editorial: Annual Reviews.
    • Observaciones: Artículo: Elith, J. and J.R. Leathwick, 2009. Species Distribution Models: Ecological Explanation and Prediction Across Space and Time. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 40: 677-697.
  • Ecological Modelling. Edición: -. Autor: Austin, M. P.. Editorial: Elsevier.
    • Observaciones: Artículo: Austin, M. P. 2002. Spatial prediction of species distribution: an interface between ecological theory and statistical modelling. Ecological Modelling 157: 101-18
  • Annual Review of Ecology and Systematics . Edición: -. Autor: Elith, J. and J.R. Leathwick. Editorial: Annual Reviews.
    • Observaciones: Artículo: Elith, J. and J.R. Leathwick, 2009. Species Distribution Models: Ecological Explanation and Prediction Across Space and Time. Annual Review of Ecology, Evolution, and Systematics 40: 677-697.
9. CRONOGRAMA

Pendiente de elaboración