Universidad de Jaén

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Guía docente 2018-19 - 76713007 - Biotecnología diagnóstica

TITULACIÓN: Máster Univ. en Biotecnología y biomedicina (76713007)
CENTRO: Centro de Estudios de Postgrado de UJA

TITULACIÓN: Doble Máster en Biotecnología y Biomedicina y MFPES (Profesorado) (77913007)
CENTRO: Centro de Estudios de Postgrado de UJA

CURSO ACADÉMICO: 2018-19
GUÍA DOCENTE
1. DATOS BÁSICOS DE LA ASIGNATURA
NOMBRE: Biotecnología diagnóstica
CÓDIGO: 76713007 (*) CURSO ACADÉMICO: 2018-19
TIPO: Optativa
Créditos ECTS: 3.0 CURSO: 1 CUATRIMESTRE: SC
WEB: http://dv.ujaen.es/docencia/goto_docencia_crs_250401.html
 
2. DATOS BÁSICOS DEL PROFESORADO
NOMBRE: CARUZ ARCOS, ANTONIO JOSÉ
IMPARTE: Teoría [Profesor responsable]
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 420 - GENÉTICA
N. DESPACHO: B3 - 344 E-MAIL: caruz@ujaen.es TLF: 953212706
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/58224
URL WEB: www.ujaen.es/investiga/inmunoge
 
NOMBRE: DOMÍNGUEZ MACÍAS, JORGE NICOLÁS
IMPARTE: Teoría
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 050 - BIOLOGÍA CELULAR
N. DESPACHO: 90 - - E-MAIL: jorgendm@ujaen.es TLF: -
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/45856
URL WEB: -
 
NOMBRE: LUQUE VÁZQUEZ, FRANCISCO
IMPARTE: Teoría
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 420 - GENÉTICA
N. DESPACHO: B3 - B3-346 E-MAIL: fjluque@ujaen.es TLF: 953212527
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/58234
URL WEB: http://www.ujaen.es/investiga/cvi258/
 
NOMBRE: MORAL LEAL, MARÍA LUISA DEL
IMPARTE: Teoría
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 050 - BIOLOGÍA CELULAR
N. DESPACHO: B3 - 343 E-MAIL: mlmoral@ujaen.es TLF: 953212761
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/57979
URL WEB: -
 
NOMBRE: horcajadas almansa, josé
E-MAIL: jose.horcajadas@gmail.com TLF: 676104793
URL WEB: https://www.upo.es/bmib/contenido?pag=/portal/upo/profesores/jhorcajadas/profesor
INSTITUCIÓN: Universidad Pablo de Olavide
 
NOMBRE: Ocaña, Esther
E-MAIL: Pérez TLF: 665674483
URL WEB: http://www.juntadeandalucia.es/servicioandaluzdesalud/chjunidades.php?id=222&nv=3&nv2=27&nv3=34&opcion=319
INSTITUCIÓN: Complejo Hospitalario de Jaén
 
3. PRERREQUISITOS, CONTEXTO Y RECOMENDACIONES
PRERREQUISITOS:
-
CONTEXTO DENTRO DE LA TITULACIÓN:

Esta asignatura está ubicada en el Módulo 3: Biotecnología, en el que se muestran las aplicaciones de la Biología Molecular y Celular para la creación de nuevas oportunidades tecnológicas, obtención de nuevos productos y el incremento de la productividad, calidad y seguridad en diferentes ámbitos del sector productivo. Los últimos avances biotecnológicos han revolucionado el diagnóstico de muchas enfermedades. Actualmente existen gran cantidad de técnicas que pueden utilizarse rutinariamente para la detección de mutaciones en genes de interés, de marcadores que indiquen el desarrollo de una patología, o para el marcaje de poblaciones celulares específicas. El reciente desarrollo de poderosas técnicas de secuenciación masiva ha permitido que empiecen a realizarse ambiciosos proyectos para definir genes implicados en la susceptibilidad a diversas patologías y la respuesta a fármacos, lo que llevará en un futuro a un importante incremento de las aplicaciones de las técnicas de análisis de secuencias de DNA para el uso diagnóstico. Con esta asignatura se pretende pues proporcionar una visión global sobre técnicas moleculares de última generación aplicadas al diagnóstico, permitiéndo la elección de aquellas más adecuadas en cada situación particular. Estás técnicas moleculares con frecuencia se utilizan en los laboratorios en combinación con técnicas de Citología e Histología molecular. Por ello se pretende además profundizar en la aplicabilidad y utilidad de los métodos de Citología e Histología molecular, ampliamente difundidos y aceptados en disciplinas biológicas y biomédicas. Dichos métodos se presentan como abordajes de elección en estudios de correlación estructura/función que incluyen la localización intracelular o extracelular de una molécula antigénica, el marcaje de poblaciones celulares específicas, así como la detección de marcadores que indiquen el desarrollo de una patología. El alumnado obtendrá en esta asignatura una formación amplia y eminentemente práctica sobre las diferentes tecnologías moleculares utilizadas en el diagnóstico.

RECOMENDACIONES Y ADAPTACIONES CURRICULARES:
-
El alumnado que presente necesidades específicas de apoyo educativo, lo ha de notificar personalmente al Servicio de Atención y Ayudas al Estudiante para proceder a realizar, en su caso, la adaptación curricular correspondiente.
4. COMPETENCIAS Y RESULTADOS DE APRENDIZAJE
código Denominación de la competencia
CB10 Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo.
CB6 Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación
CB7 Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio
CB8 Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios
CB9 Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades
CG1 Manejar bibliografía y documentación científica en inglés
CG2 Diseñar y planificar experimentos de investigación
CG3 Ejecutar experimentos de investigación así como interpretar los resultados
CG4 Diseñar estrategias experimentales alternativas
CG6 Capacidad de crítica y argumentación así como de exposición escrita y oral de proyectos de investigación y sus resultados
CO13-1 Conocer las características de la industria del diagnóstico
CO13-2 Adquirir las habilidades técnicas para la producción de reactivos de diagnóstico
CO13-3 Capacidad de realizar diagnósticos utilizando productos biotecnológicos
CT1 Fomentar el respeto a los derechos fundamentales y de igualdad de oportunidades entre hombres y mujeres, los principios de igualdad de oportunidades y accesibilidad universal de las personas con discapacidad y los valores propios de una cultura de paz y valores democráticos.
CT2 Desarrollar espíritu crítico y constructivo, con actitud positiva frente al conocimiento
CT3 Demostrar capacidad de generación de nuevas ideas (creatividad)
CT4 Desarrollar capacidad de trabajo en equipo, de líder, de diálogo, de crítica y autocrítica
CT5 Espíritu innovador y emprendedor
CT6 Motivación por la calidad
CT7 Compromiso ético con personas, organismos públicos y/o privados y con el entorno interno y externo de las organizaciones
Resultados de aprendizaje
Resultado R35 Conocer las principales estrategias para la creación, producción y comercialización de productos biotecnológicos diagnósticos
Resultado R36 Capacidad para realizar un genotipado y elegir la tecnología más adecuada para el problema planteado
Resultado R37 Conocer las principales tecnologías de cuantificación de ADN/ARN así como sus aplicaciones diagnósticas
Resultado R38 El alumno sabrá utilizar todas las tecnologías diagnósticas dependientes de anticuerpos así como determinar la estrategia experimental más adecuada para cada caso
5. CONTENIDOS

La industria del diagnóstico biotecnológico: sectores, productos, principales empresas, impacto económico. Estrategias de identificación de biomarcadores
de uso diagnóstico. Normativa de producción y comercialización de productos de diagnóstico biotecnológico. Producción y aplicaciones de anticuerpos
monoclonales: Inmunohistoquímica, Hibridación in situ, Citometría de flujo, Biosensores, tecnologías de modificación de anticuerpos, producción
industrial de anticuerpos para diagnóstico. Biología molecular en diagnóstico I: Técnicas de cuantificación de ADN/ARN y sus aplicaciones diagnósticas
(RT-PCR, Microarrays de expresión, CGH y microARNs en diagnóstico clínico). Biología molecular en diagnóstico II: técnicas de genotipado
de SNPs a escala baja, media y masiva (Veracode, GWAS). Aplicaciones en descubrimiento de biomarcadores y diagnóstico clínico. Cálculo de haplotipos
y fases de cromosomas así como sus aplicaciones. Técnicas avanzadas de secuenciación masiva (NGS) y su uso en diagnóstico. Principales estrategias
de análisis de datos.

1. La citología e histología molecular en el diagnóstico clínico:
1.1. Inmunohistoquímica (anticuerpos monoclonales y policlonales)
1.2. Hibridación in situ
2. Citometría de flujo

3. Biosensores
4. Biología molecular en diagnóstico clínico I:
4.1. Cuantificación de la expresión génica mediante PCR en tiempo real y sus aplicaciones
4.2. Técnicas de PCR en tiempo real múltiple para diagnóstico
5. Biología molecular en diagnóstico clínico II:
5.1. Técnicas avanzadas de secuenciación masiva de ADN
5.2. Técnicas de genotipado de SNPs por PCR en tiempo real
5.3. Técnicas de genotipado masivo (veracode, Illumina, etc.)
5.4. Técnicas de genotipado de variación de número de copias y microsatélites
5.5. Cálculo de haplotipos y cuantificación del riesgo genético
5.6. Microarrays de expresión, CGH y microRNAs en diagnóstico clínico, aplicación a la caracterización de
tumores y la receptividad endometrial.
6. Análisis de paternidades y genética forense
7. Consejo genético y cálculo de probabilidades
8. Biotecnología de producción de reactivos de diagnóstico
9. Normativa, legislación y patentes en diagnóstico molecular

6. METODOLOGÍA Y ACTIVIDADES
ACTIVIDADES HORAS PRESEN­CIALES HORAS TRABAJO AUTÓ­NOMO TOTAL HORAS CRÉDITOS ECTS COMPETENCIAS (códigos)
A1 - Clases expositivas en gran grupo
  • M2 - Exposición de teoría y ejemplos generales
  • M35 - Clases expositivas: Clases magistrales
  • M4 - Conferencias, seminarios, etc
16.0 0.0 16.0 0.64
  • CB10
  • CB6
  • CB7
  • CB8
  • CB9
  • CG1
  • CG2
  • CG4
  • CG6
  • CO13-1
  • CO13-2
  • CO13-3
  • CT1
  • CT2
  • CT3
  • CT4
  • CT5
  • CT6
  • CT7
A2 - Clases en grupos de prácticas
  • M 33 - Seminarios, laboratorio, manejo de PC, resolución de ejercicios, trabajos dirigidos
  • M11 - Resolución de ejercicios
  • M8 - Debates
12.0 0.0 12.0 0.48
  • CB10
  • CB6
  • CB7
  • CB8
  • CB9
  • CG1
  • CG2
  • CG3
  • CG4
  • CG6
  • CO13-1
  • CO13-2
  • CO13-3
  • CT1
  • CT2
  • CT3
  • CT4
  • CT5
  • CT6
  • CT7
A21 - Trabajo autónomo del alumno (estudio, lecturas, p.inf., ejerc., etc.)
  • M13 - Otras actividades
45.0 0.0 45.0 1.8
  • CG1
  • CO13-1
  • CO13-2
  • CO13-3
A3 - Tutorías colectivas
  • M14 - Foros
2.0 0.0 2.0 0.08
  • CO13-1
  • CO13-2
  • CO13-3
TOTALES: 75.0 0.0 75.0 3.0  
 
INFORMACIÓN DETALLADA:

Sesiones de clases magistrales en gran grupo en la que se expondrán los contenidos teóricos esenciales. Cuatro conferenciantes invitados externos, expertos en biotecnología diagnóstica y vinculados con el mundo empresarial y hospitalario (biosensores, microarrays, secuenciación masiva y genética clínica). Clases de prácticas en la que se realizarán diferentes técnicas de diagnóstico inmunohistoquímico y genético así como el análisis de datos masivos de genotipación. Seminarios de los alumnos y sesiones de debate sobre casos reales.

7. SISTEMA DE EVALUACIÓN
 
ASPECTO CRITERIOS INSTRUMENTO PESO
Asistencia y/o participación en actividades presenciales y/o virtuales Valoración de la asistencia Registro 15.0%
Valoración de trabajo escrito Valoración de la participación Observación 10.0%
Conceptos teóricos de la materia Valoración de los conocimientos sobre conceptos teóricos de la materia Examen 10.0%
Realización de trabajos, casos o ejercicios Valoración de la capacidad de realización de trabajos, casos o ejercicios Trabajos 15.0%
Prácticas de laboratorio/campo/uso de herramientas TIC Valoración de la destreza en la realización de prácticas de laboratorio/ campo/informática Prácticas 10.0%
Informe del tutor de Prácticas Externas Valoración de la capacidad de realizar presentaciones/exposiciones/seminarios/ debates Trabajos 20.0%
Participación y Actividad en foros virtuales Valoración de la participación . 10.0%
Autoevaluación Valoración de la capacidad de realizar presentaciones/exposiciones/seminarios/ debates Seminarios 10.0%
El sistema de calificación se regirá por lo establecido en el RD 1125/2003 de 5 de septiembre por el que se establece el sistema europeo de créditos y el sistema de calificaciones en la titulaciones universitarias de carácter oficial
INFORMACIÓN DETALLADA:

Para evaluar la asistencia a las clases tanto teóricas como prácticas se procederá a pasar lista en cada sesión. Se evaluará la proactividad y participación del alumnado en todas las actividades propuestas, siendo especialmente significativa la capacidad de debate y argumentación en la discusión posterior a los seminarios. Así como en las preguntas y cuestiones teóricas planteadas por el profesorado a lo largo de las clases teóricas y prácticas. Cada alumno debe entregar un informe de las prácticas realizadas, un trabajo consistente en la revisión de un tema o de un artículo científico, así como debe impartir un seminario. 

8. DOCUMENTACIÓN / BIBLIOGRAFÍA
ESPECÍFICA O BÁSICA:
  • Clinical Genomics. Edición: -. Autor: -. Editorial: London [etc.] : Academic Press, cop. 2014  (C. Biblioteca)
  • Molecular cloning : a laboratory manual. Edición: 4th ed. Autor: Green, Michael R. Michael Richard, 1954-. Editorial: Cold Spring Harbor, N.Y. : Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012  (C. Biblioteca)
  • Human molecular genetics. Edición: 4th ed.. Autor: Strachan, T.. Editorial: New York : Garland Science Taylor & Francis Group, c2010.  (C. Biblioteca)
  • Clinical Genomics. Edición: -. Autor: -. Editorial: London [etc.] : Academic Press, cop. 2014  (C. Biblioteca)
  • Molecular cloning : a laboratory manual. Edición: 4th ed. Autor: Green, Michael R. Michael Richard, 1954-. Editorial: Cold Spring Harbor, N.Y. : Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012  (C. Biblioteca)
  • Human molecular genetics. Edición: 4th ed.. Autor: Strachan, T.. Editorial: New York : Garland Science Taylor & Francis Group, c2010.  (C. Biblioteca)
  • Clinical Genomics. Edición: -. Autor: -. Editorial: London [etc.] : Academic Press, cop. 2014  (C. Biblioteca)
  • Molecular cloning : a laboratory manual. Edición: 4th ed. Autor: Green, Michael R. Michael Richard, 1954-. Editorial: Cold Spring Harbor, N.Y. : Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012  (C. Biblioteca)
  • Human molecular genetics. Edición: 4th ed.. Autor: Strachan, T.. Editorial: New York : Garland Science Taylor & Francis Group, c2010.  (C. Biblioteca)
  • Clinical Genomics. Edición: -. Autor: -. Editorial: London [etc.] : Academic Press, cop. 2014  (C. Biblioteca)
  • Molecular cloning : a laboratory manual. Edición: 4th ed. Autor: Green, Michael R. Michael Richard, 1954-. Editorial: Cold Spring Harbor, N.Y. : Cold Spring Harbor Laboratory Press, 2012  (C. Biblioteca)
  • Human molecular genetics. Edición: 4th ed.. Autor: Strachan, T.. Editorial: New York : Garland Science Taylor & Francis Group, c2010.  (C. Biblioteca)
GENERAL Y COMPLEMENTARIA:
  • Apoptosis, Cell Signaling, and Human Diseases [Recurso electrónico] : Molecular Mechanisms. Edición: -. Autor: Srivastava, Rakesh. Editorial: Totowa, NJ : Humana Press Inc., 2007.  (C. Biblioteca)
  • In situ detection of DNA damage: methods and protocols. Edición: -. Autor: -. Editorial: Totowa: Humana Press, cop. 2002  (C. Biblioteca)
  • Flow Cytometry [Recurso electrónico] : Principles and Applications. Edición: -. Autor: Macey, Marion G.. Editorial: Totowa, NJ : Humana Press Inc., 2007.  (C. Biblioteca)
  • Clinical Applications of PCR [Recurso electrónico] . Edición: -. Autor: Lo, Y. M. Dennis. Editorial: Totowa, NJ : Humana Press Inc., 2006.  (C. Biblioteca)
  • Legislación de marcas, patentes y diseño industrial. Edición: 2ª ed., 2014. Autor: -. Editorial: Madrid : Civitas-Thomson Reuters, 2014  (C. Biblioteca)
  • Current protocols in molecular biology. Edición: -. Autor: -. Editorial: [United States]: John Wiley and Sons, cop. 1998-  (C. Biblioteca)
  • Apoptosis, Cell Signaling, and Human Diseases [Recurso electrónico] : Molecular Mechanisms. Edición: -. Autor: Srivastava, Rakesh. Editorial: Totowa, NJ : Humana Press Inc., 2007.  (C. Biblioteca)
  • In situ detection of DNA damage: methods and protocols. Edición: -. Autor: -. Editorial: Totowa: Humana Press, cop. 2002  (C. Biblioteca)
  • Flow Cytometry [Recurso electrónico] : Principles and Applications. Edición: -. Autor: Macey, Marion G.. Editorial: Totowa, NJ : Humana Press Inc., 2007.  (C. Biblioteca)
  • Clinical Applications of PCR [Recurso electrónico] . Edición: -. Autor: Lo, Y. M. Dennis. Editorial: Totowa, NJ : Humana Press Inc., 2006.  (C. Biblioteca)
  • Legislación de marcas, patentes y diseño industrial. Edición: 2ª ed., 2014. Autor: -. Editorial: Madrid : Civitas-Thomson Reuters, 2014  (C. Biblioteca)
  • Current protocols in molecular biology. Edición: -. Autor: -. Editorial: [United States]: John Wiley and Sons, cop. 1998-  (C. Biblioteca)
  • Apoptosis, Cell Signaling, and Human Diseases [Recurso electrónico] : Molecular Mechanisms. Edición: -. Autor: Srivastava, Rakesh. Editorial: Totowa, NJ : Humana Press Inc., 2007.  (C. Biblioteca)
  • In situ detection of DNA damage: methods and protocols. Edición: -. Autor: -. Editorial: Totowa: Humana Press, cop. 2002  (C. Biblioteca)
  • Flow Cytometry [Recurso electrónico] : Principles and Applications. Edición: -. Autor: Macey, Marion G.. Editorial: Totowa, NJ : Humana Press Inc., 2007.  (C. Biblioteca)
  • Clinical Applications of PCR [Recurso electrónico] . Edición: -. Autor: Lo, Y. M. Dennis. Editorial: Totowa, NJ : Humana Press Inc., 2006.  (C. Biblioteca)
  • Legislación de marcas, patentes y diseño industrial. Edición: 2ª ed., 2014. Autor: -. Editorial: Madrid : Civitas-Thomson Reuters, 2014  (C. Biblioteca)
  • Current protocols in molecular biology. Edición: -. Autor: -. Editorial: [United States]: John Wiley and Sons, cop. 1998-  (C. Biblioteca)
  • Apoptosis, Cell Signaling, and Human Diseases [Recurso electrónico] : Molecular Mechanisms. Edición: -. Autor: Srivastava, Rakesh. Editorial: Totowa, NJ : Humana Press Inc., 2007.  (C. Biblioteca)
  • In situ detection of DNA damage: methods and protocols. Edición: -. Autor: -. Editorial: Totowa: Humana Press, cop. 2002  (C. Biblioteca)
  • Flow Cytometry [Recurso electrónico] : Principles and Applications. Edición: -. Autor: Macey, Marion G.. Editorial: Totowa, NJ : Humana Press Inc., 2007.  (C. Biblioteca)
  • Clinical Applications of PCR [Recurso electrónico] . Edición: -. Autor: Lo, Y. M. Dennis. Editorial: Totowa, NJ : Humana Press Inc., 2006.  (C. Biblioteca)
  • Legislación de marcas, patentes y diseño industrial. Edición: 2ª ed., 2014. Autor: -. Editorial: Madrid : Civitas-Thomson Reuters, 2014  (C. Biblioteca)
  • Current protocols in molecular biology. Edición: -. Autor: -. Editorial: [United States]: John Wiley and Sons, cop. 1998-  (C. Biblioteca)
9. CRONOGRAMA

La asignatura consta de 9 módulos, 12 clases teóricas, 2 clases para presentación de seminarios y una clase de tutoría colectiva.

Módulos 1,2,3 y 4: semana del 2 al 6 de abril

Módulos 5, 6 y7: semana del 9 al 13 de abril

Módulos 6, 7, 8 ,9: semana del 16 al 20 de abril

Presentación de seminarios20 de abril