Universidad de Jaén

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Guía docente 2015-16 - 10312018 - Bioquímica



TITULACIÓN: Grado en Química
CENTRO: FACULTAD DE CIENCIAS EXPERIMENTALES
CURSO: 2015-16
ASIGNATURA: Bioquímica
GUÍA DOCENTE
1. DATOS BÁSICOS DE LA ASIGNATURA
NOMBRE: Bioquímica
CÓDIGO: 10312018 CURSO ACADÉMICO: 2015-16
TIPO: Obligatoria
Créditos ECTS: 9.0 CURSO: 4 CUATRIMESTRE: SC
WEB: http://dv.ujaen.es/docencia/goto_docencia_crs_351657.html
2. DATOS BÁSICOS DEL PROFESORADO
NOMBRE: CAÑUELO NAVARRO, ANA ROSA
IMPARTE: Teoría - Prácticas [Profesor responsable]
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 060 - BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR
N. DESPACHO: B3 - 302 E-MAIL: acanuelo@ujaen.es TLF: 2767
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/42768
URL WEB: http://www4.ujaen.es/~acanuelo/
ORCID: https://orcid.org/0000-0001-5626-4484
NOMBRE: PEDRAJAS CABRERA, JOSÉ RAFAEL
IMPARTE: Teoría - Prácticas
DEPARTAMENTO: U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
ÁREA: 060 - BIOQUÍMICA Y BIOLOGÍA MOLECULAR
N. DESPACHO: B3 - 348 E-MAIL: pedrajas@ujaen.es TLF: 953213634
TUTORÍAS: https://uvirtual.ujaen.es/pub/es/informacionacademica/tutorias/p/58291
URL WEB: https://www.ujaen.es/departamentos/bioexp/contactos/pedrajas-cabrera-jose-rafael
ORCID: https://orcid.org/0000-0003-1998-0638
3. PRERREQUISITOS, CONTEXTO Y RECOMENDACIONES
PRERREQUISITOS:

No se han establecido requisitos previos para esta materia.

CONTEXTO DENTRO DE LA TITULACIÓN:

Bioquímica es una asignatura obligatoria, ubicada en el módulo fundamental, que se imparte en el segundo cuatrimestre de cuarto curso coincidiendo temporalmente con la última asignatura optativa y la realización del trabajo fin de grado. En ella se estudia la estructura química y función de las biomoléculas y la química de los principales procesos biológicos, integrando y complementando los conocimientos obtenidos previamente por el estudiante en las diferentes facetas de la Química.

RECOMENDACIONES Y ADAPTACIONES CURRICULARES:

Se recomienda un nivel de inglés apropiado para entender la bibliografía básica. Para estudiantes "Erasmus" se suministrará material y bibliografía en Inglés. Además se ofrecerá la posibilidad de realizar tutorías y pruebas de evaluación también en Inglés.

El alumnado que presente necesidades específicas de apoyo educativo, lo ha de notificar personalmente al Servicio de Atención y Ayudas al Estudiante para proceder a realizar, en su caso, la adaptación curricular correspondiente.
4. COMPETENCIAS Y RESULTADOS DE APRENDIZAJE
Código Denominación de la competencia
B1 Capacidad de análisis y síntesis
B6 Resolución de problemas
C15 Identificar la estructura y reactividad de las principales clases de biomoléculas y la química de los principales procesos biológicos.
C16 Relacionar el fundamento de las técnicas instrumentales y sus aplicaciones.
P5 Interpretación de datos procedentes de observaciones y medidas en el laboratorio en términos de su significación y de las teorías que la sustentan.
Q2 Capacidad para aplicar dichos conocimientos a la resolución de problemas cualitativos y cuantitativos según modelos previamente desarrollados.
 
Resultados de aprendizaje
Resultado 312018A - Comprende la estructura de las grandes macromoléculas biológicas (proteínas, ácidos nucleicos y polisacáridos) y de los grandes agregados biológicos (membranas y bicapas), los factores que la determinan y cómo su función está condicionada por su estructura.
Resultado 312018B - Conoce cuáles son las reacciones químicas de mayor importancia en los procesos biológicos, entender sus mecanismos y los factores que las controlan.
Resultado 312018C - Conoce cuáles son los factores cinéticos y termodinámicos que controlan la acción catalítica enzimática, los procesos cooperativos y los inhibitorios.
Resultado 312018D - Conoce los aspectos más básicos del funcionamiento de las células y entenderlos en términos químicos. Conocer los hechos básicos del metabolismo y las rutas metabólicas.
Resultado 312018E - Conoce los fundamentos de la biosíntesis de proteínas y ácidos nucleicos.
Resultado 312018F - Adquiere la formación e instrucción prácticas necesarias para aplicar de manera satisfactoria los métodos experimentales más sencillos usados en Bioquímica y Química Biológica.
Resultado 312018G - Desarrolla una actitud crítica, de perfeccionamiento en la labor experimental buscando soluciones a los problemas diarios en el laboratorio incluyendo los aspectos de seguridad.
Resultado 312018H - Adquiere los fundamentos teóricos que permitan la comprensión del comportamiento de los sistemas biológicos en términos de procesos químicos
Resultado 312018I - Habilidad para la manipulación segura de muestras biológicas con fines analíticos o preparativos en laboratorios biosanitarios.
Resultado 312018J - Explica de manera comprensible fenómenos y procesos relacionados con la Bioquímica y Química Biológica.
Resultado 312018K - Comprende y utiliza la información bibliográfica y técnica referida a los compuestos bioquímicos
5. CONTENIDOS

Estructura y función de macromoléculas y membranas biológicas. Catálisis y control de las reacciones bioquímicas. La función de los metales en los procesos biológicos. Bioenergética. Metabolismo.
Información genética. Estructura, propiedades y reactividad química de biomoléculas.
Metodología en Bioquímica y Biología Molecular.

 

PROGRAMA DE TEORÍA

 

Tema 1.      Introducción a la Bioquímica y Biología Molecular. Campo de estudio de la Bioquímica y la Biología Molecular. Bioelementos y biomoléculas.

 

Bloque I: Estructura y función biológica de glúcidos, lípidos y proteínas

Tema 2.      Estructura y función biológica de los glúcidos. Concepto, nomenclatura, clasificación y funciones. Monosacáridos y sus derivados. Disacáridos y oligosacáridos. Polisacáridos: características generales, homopolisacáridos de reserva, homopolisacáridos estructurales, heteropolisacáridos.

Tema 3.      Estructura y función de los lípidos y de las membranas biológicas. Ácidos grasos. Triacilglicéridos. Glicerofosfolípidos. Esfingolípidos. Colesterol y derivados. Eicosanoides. Vitaminas liposolubles. Estructura y función de las membranas biológicas.

Tema 4.      Estructura de las proteínas. Aminoácidos y enlace peptídico. Estructura primaria. Estructuras secundarias regulares: hélice alfa, estructura beta, hélice de colágeno. Regiones con estructura 2ª no repetitiva: bucles, giros. Motivos estructurales. Estructura terciaria y dominios estructurales. Estructura cuaternaria.

Tema 5.      Proteínas: relación estructura y función. Proteínas fibrosas: queratina, colágeno y elastina. Proteínas globulares: mioglobina y hemoglobina.

Tema 6.      Dinámica de proteínas y proteómica. Plegamiento, transporte, maduración y degradación de proteínas en el interior de la célula. Fundamentos, técnicas y aplicaciones de la proteómica.

 

Bloque II: Enzimología

Tema 7.      Catálisis enzimática. Concepto de enzima. Características generales. Nomenclatura y clasificación. Modo de actuación de las enzimas. Mecanismos de catálisis enzimática. Coenzimas y vitaminas.

Tema 8.      Cinética enzimática. Estado estacionario. Velocidad inicial. Efecto de la concentración de enzima, pH y temperatura. Efecto de la concentración de sustrato. Ecuación de Michaelis-Menten. Representación de Lineweaver-Burk. Reacciones multisustrato. Inhibición enzimática.  

Tema 9.      Regulación de la actividad enzimática. Control celular de la actividad enzimática. Enzimas reguladoras: regulación alostérica y regulación por modificación covalente. Otras formas de regulación: isoenzimas, complejos multienzimáticos, enzimas multifuncionales, zimógenos.

 

Bloque III. Estructura y función de los ácidos nucleicos

Tema 10.    Estructura de los ácidos nucleicos. Bases nitrogenadas. Nucleósidos. Estructura y funciones de los nucleótidos. Polinucleótidos. Estructura primaria de los ácidos nucleicos. El ADN como material genético. La doble hélice de Watson y Crick (ADN-B); propiedades y relación estructura-función. Otras estructuras alternativas del ADN. Organización y empaquetamiento del ADN en células eucariotas. Estructura y tipos de ARN; función biológica.

Tema 11.    Replicación del material genético. Características generales del proceso de replicación del ADN. Enzimas implicadas en la replicación. Proceso global de replicación en procariotas: iniciación, elongación y terminación. Diferencias entre la replicación en procariotas y eucariotas.

Tema 12.    Transcripción. Características generales de la transcripción. ARN polimerasa. Etapas de la transcripción en procariotas: iniciación, elongación y terminación. Diferencias entre la transcripción en procariotas y eucariotas. Maduración y procesamiento del ARN.

Tema 13.    Síntesis de proteínas. El código genético. Mutaciones. Estructura de los ribosomas. Etapas de la traducción en procariotas: activación de los aminoácidos, iniciación, elongación y terminación. Gasto energético del proceso. Diferencias entre la traducción en procariotas y eucariotas.

Tema 14.    Técnicas de manipulación de ácidos nucleicos. Aislamiento, extracción y purificación de ácidos nucleicos. Hibridación. Reacción en cadena de la polimerasa. Restricción y técnicas de ADN recombinante. Genómica.

 

Bloque IV. Metabolismo intermediario

Tema 15.    Características generales de las rutas metabólicas. Metabolismo intermediario: definición, funciones y organización. Rutas catabólicas, anabólicas y anfibólicas. Necesidad y mecanismos generales de regulación.

Tema 16.    Bioenergética. Termodinámica de los procesos bioquímicos. Compuestos ricos en energía. Transportadores de electrones.

Tema 17.    Glucólisis y fermentaciones. Función biológica y localización subcelular. Descripción de la ruta. Balance energético. Regulación. Rutas alimentadoras de la glucólisis. Fermentaciones. Sistemas lanzadera para el ingreso de electrones citoplasmáticos en la mitocondria

Tema 18.    Ciclo de los ácidos tricarboxílicos (Ciclo de Krebs). Descarboxilación oxidativa del piruvato. Descripción del ciclo de los ácidos tricarboxílicos. Regulación. Reacciones anapleróticas. Carácter anfibólico del ciclo.

Tema 19.    Cadena de transporte electrónico y fosforilación oxidativa. Generalidades. Organización y funcionamiento de la cadena de transporte electrónico. Fosforilación oxidativa: mecanismo quimiosmótico. Estructura y mecanismo de acción de la ATP sintasa.

Tema 20.    Metabolismo del glucógeno. Biosíntesis y catabolismo. Regulación.

Tema 21.    Otras rutas del metabolismo glucídico. Ruta de las pentosas fosfato: importancia y etapas. Gluconeogénesis: generalidades y precursores. Gluconeogénesis a partir de piruvato, lactato, aminoácidos, intermediarios del ciclo de Krebs, glicerol y propionato. Ciclo del glioxilato.

Tema 22.    Fotosíntesis. Pigmentos fotosintéticos y fotofosforilación. Ciclo de Calvin-Benson.

Tema 23.    Metabolismo de lípidos. Almacenamiento y movilización de triacilglicéridos. Oxidación de los ácidos grasos. Metabolismo de los cuerpos cetónicos. Síntesis de ácidos grasos. Metabolismo de triacilglicéridos y glicerofosfolípidos. Metabolismo de esfingolípidos. Metabolismo del colesterol. Transporte de lípidos: lipoproteínas.

Tema 24.    Metabolismo de los compuestos nitrogenados. Recambio proteico. Mecanismos generales de degradación de aminoácidos. Destoxificación y excreción de amonio. Ciclo de la urea.

Tema 25.    Integración metabólica. Perfil metabólico de los principales órganos y tejidos. Interrelaciones metabólicas en diferentes situaciones fisiológicas y patológicas.

 

PROGRAMA DE PROBLEMAS

Determinación de secuencias peptídicas.

Enzimología: determinación de parámetros cinéticos e inhibición enzimática.

Ácidos nucleicos y flujo de la información genética: código genético y mutaciones.

Bioenergética y metabolismo.

 

PROGRAMA DE PRÁCTICAS DE LABORATORIO

 

PRÁCTICA 1. Purificación y caracterización de una enzima (glutation S-transferasa):

Sesión 1. Caracterización cinética de la enzima: determinación de K m y V máx (Lab.1).

Sesión 2.    Fraccionamiento proteico por precipitación con sulfato amónico (Lab. 2).

Sesión 3.    Purificación por cromatografía de intercambio iónico. Realización de una tabla de purificación (Lab. 3).

Sesión 4.  Determinación de la concentración de proteínas y realización de la tabla de purificación (Lab. 4).

PRÁCTICA 2. Determinación del nivel de expresión de la Glutation S-transferasa mediante Western-blot.

Sesión 5.    Electroforesis en geles de poliacrilamida en condiciones desnaturalizantes (SDS-PAGE) (Lab. 5).

Sesión 6. Inmunodetección (Lab. 6).

PRÁCTICA 3. Amplificación de un a secuencia de ADN mediante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR)

Sesión 7. Identificación de colonias transformadas mediante PCR (Lab. 7)

Presentación y discusión de resultados (Lab. 8).

6. METODOLOGÍA Y ACTIVIDADES
 
ACTIVIDADES HORAS PRESEN­CIALES HORAS TRABAJO AUTÓ­NOMO TOTAL HORAS CRÉDITOS ECTS COMPETENCIAS (códigos)
A1 - Clases expositivas en gran grupo
  • M1 - Clases magistrales
  • M2 - Exposición de teoría y ejemplos generales
  • M5 - Otros
44.0 66.0 110.0 4.4
  • B1
  • B6
  • C15
A2 - Clases en grupos de prácticas
  • M10 - Aulas de informática
  • M11 - Resolución de ejercicios
  • M12 - Presentaciones/exposiciones
  • M6 - Actividades prácticas
  • M7 - Seminarios
  • M8 - Debates
  • M9 - Laboratorios
44.0 66.0 110.0 4.4
  • B1
  • B6
  • C15
  • C16
  • P5
  • Q2
A3 - Tutorías colectivas
  • M14 - Supervisión de trabajos dirigidos
  • M17 - Aclaración de dudas
  • M18 - Comentarios de trabajos individuales
2.0 3.0 5.0 0.2
  • B1
  • B6
  • Q2
TOTALES: 90.0 135.0 225.0 9.0  
 
INFORMACIÓN DETALLADA:

- Sesiones académicas teóricas (al gran grupo) en las que se desarrollará el programa de teoría propuesto.

- Sesiones de prácticas de laboratorio (al pequeño grupo) en las que los estudiantes realizarán, en el laboratorio, de forma interactiva, diferentes técnicas y métodos experimentales. Los resultados obtenidos deberán ser analizados, discutidos y presentados en un cuaderno de prácticas.

- Sesiones de problemas (al pequeño grupo) en las que los estudiantes deberán resolver problemas prácticos aplicando los conocimientos adquiridos en las diferentes partes de la asignatura.

- Seminarios con exposición y debate, realizados por grupos de 2 ó 3 alumnos sobre temas de interés o ampliación del temario.

- Tutorías (individuales y colectivas) en las que el alumno podrá plantear todas aquellas cuestiones o dudas relacionadas con los aspectos teóricos y prácticos de la asignatura.

7. SISTEMA DE EVALUACIÓN
 
ASPECTO CRITERIOS INSTRUMENTO PESO
Conceptos teóricos de la materia Valoración de los conocimientos teóricos adquiridos y su aplicación. Nota mínima en teoría para considerar la calificación del resto de aspectos: 4 puntos. Pruebas escritas. Se realizarán varias pruebas de evaluación continua (eliminatorias a partir de 5 puntos) y una prueba final. 60.0%
Realización de trabajos, casos o ejercicios Aprendizaje Basado en Problemas: Valoración del planteamiento y resolución de problemas (10%). Seminarios: Valoración de la estructura, contenidos, recursos utilizados en su elaboración, claridad en la exposición y defensa de la actividad (5%) El aprendizaje basado en problemas, se evaluará mediante la realización de pruebas escritas de evaluación continua y una prueba final. Los seminarios se evaluarán mediante la observación, pregunta, revisión y valoración por parte del profesorado. 15.0%
Prácticas de laboratorio/campo/uso de herramientas TIC La asistencia a las sesiones prácticas y la entrega de resultados son obligatorias. Se evaluarán las aptitudes y actitudes demostradas durante el desarrollo de las sesiones así como el procesamiento y discusión de los resultados obtenidos. Hojas de asistencia y control de entrega de resultados. El trabajo en el laboratorio se evaluará mediante un examen práctico. 25.0%
El sistema de calificación se regirá por lo establecido en el RD 1125/2003 de 5 de septiembre por el que se establece el sistema europeo de créditos y el sistema de calificaciones en la titulaciones universitarias de carácter oficial
INFORMACIÓN DETALLADA:

Dentro del apartado S3 el 10% corresponderá a problemas y el 5% a los seminarios.

Con los diferentes apartados se evaluarán las competencias de la siguiente manera:

S2: Bi, CE15 y CE16.

S3: Q2, B1 y B6.

S4: P5, B1 y C16.

8. DOCUMENTACIÓN / BIBLIOGRAFÍA
ESPECÍFICA O BÁSICA:
  • Lehninger: principios de bioquímica. Edición: 5ª ed.. Autor: Nelson, David L., 1942-. Editorial: Barcelona : Omega, 2009.  (C. Biblioteca)
  • Bioquímica. Edición: 3̇ ed.. Autor: Mathews, Christopher K.. Editorial: Madrid : Addison Wesley, 2004.  (C. Biblioteca)
  • Fundamentos de bioquímica: la vida a nivel molecular. Edición: 2ª̇ ed.. Autor: Voet, Donald. Editorial: Buenos Aires [etc.]: Médica Panamericana, cop. 2007.  (C. Biblioteca)
  • Bioquímica. Edición: 6ª̇ ed.. Autor: Berg, Jeremy Mark.. Editorial: Barcelona [etc.] : Reverté, 2008  (C. Biblioteca)
GENERAL Y COMPLEMENTARIA:
  • Principles of biochemistry. Edición: 3rd ed. Autor: -. Editorial: Upper Saddle River: Prentice-Hall, cop. 2002  (C. Biblioteca)
9. CRONOGRAMA (segundo cuatrimestre)
 
Semana A1 - Clases expositivas en gran grupo A2 - Clases en grupos de prácticas A3 - Tutorías colectivas Trabajo autónomo Observaciones
Nº 1
25 - 31 ene. 2016
4.00.00.0 0.0   
Nº 2
1 - 7 feb. 2016
3.00.00.0 0.0   
Nº 3
8 - 14 feb. 2016
2.02.00.0 0.0   
Nº 4
15 - 21 feb. 2016
3.02.00.0 0.0   
Nº 5
22 - 28 feb. 2016
3.02.00.0 0.0   
Nº 6
29 feb. - 6 mar. 2016
3.00.01.0 0.0   
Nº 7
7 - 13 mar. 2016
3.00.00.0 0.0   
Nº 8
14 - 18 mar. 2016
3.00.00.0 0.0   
Período no docente: 19 - 27 mar. 2016
Nº 9
28 mar. - 3 abr. 2016
3.02.00.0 0.0   
Nº 10
4 - 10 abr. 2016
3.02.00.0 0.0   
Nº 11
11 - 17 abr. 2016
3.012.00.0 0.0   
Nº 12
18 - 24 abr. 2016
1.010.00.0 0.0   
Nº 13
25 abr. - 1 may. 2016
4.010.00.0 0.0   
Nº 14
2 - 8 may. 2016
3.02.00.0 0.0   
Nº 15
9 - 13 may. 2016
3.00.01.0 0.0   
Total Horas 44.0 44.0 2.0 0.0