Universidad de Jaén

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El objetivo general de esta asignatura es proporcionar al alumno una base sólida en Microbiología General, tanto en principios conceptuales como en aplicaciones, de manera que pueda comprender y asimilar los conocimientos impartidos en asignaturas más específicas que se desarrollarán en asignaturas de cursos superiores

- El alumnado que presente necesidades específicas de apoyo educativo, lo ha de notificar personalmente al Servicio de Atención y Ayudas al Estudiante para proceder a realizar, en su caso, la adaptación curricular correspondiente.

1. Concepto y desarrollo de la Microbiología 2. Estructura y tipos de microorganismos 3. Características generales de los Procariotas. Métodos de observación y estudio 4. Estructura de los Procariotas 5. Nutrición y Metabolismo Energético Bacteriano 6. Crecimiento bacteriano 7. Genética bacteriana 8. Diversidad de los Procariotas 9. Las Arqueas 10. Bacterias termófilas y bacterias fotosintéticas no proteobacterias 11. Proteobacterias 12. Firmicutes con bajo G+C y Actinobacteria 13. Espiroquetas y Otras líneas filogenéticos 14. Los Virus y partículas subvirales. Características generales, métodos de estudio y grupos de virus. Bacteriófagos. Virus de eucariotas 15. Distribución de los microorganismos en la Biosfera. Papel de los microorganismos en los ciclos biogeoquímicos. Interacciones de los microorganismos con el resto de seres vivos 16. Aplicaciones biotecnológicas de los microorganismos.

PROGRAMA DE CLASES TEÓRICAS I. INTRODUCCIÓN A LA MICROBIOLOGÍA * TEMA 1. CONCEPTO Y DESARROLLO DE LA MICROBIOLOGÍA. 1.1.- Definición de microorganismo. 1.2.- Historia de la Microbiología. 1.2.1.- El descubrimiento de los microorganismos. Leeuwenhoek. 1.2.2.- Controversia acerca de la generación espontánea. Pasteur. 1.2.3.- Desarrollo de la Microbiología clínica. Postulados de Koch. 1.3.- Presente y futuro de la Microbiología. 1.3.1.- Microbiología Clínica. 1.3.2.- Microbiología Aplicada. * TEMA 2. ESTRUCTURA Y TIPOS DE MICROORGANISMOS 2.1.- Dominios Eukarya, Bacteria y Archea. 2.2.- La célula procariota y eucariota: Principales diferencias. 2.3.- Los virus y partículas subvirásicas: Viroides, virusoides y priones. 2.3.1.- Los virus. 2.3.1.1.- Características biológicas. 2.3.1.2.- Estructura fundamental. 2.3.1.3.- Estructuras no presentes en todos los virus. 2.3.1.4.- Origen de los virus 2.3.2.- Partículas subvirásicas 2.3.2.1.- Viroides 2.3.2.2.- Virusoides 2.3.2.3.- Priones II. VIROLOGÍA * TEMA 3. INTRODUCCIÓN A LA VIROLOGÍA. 3.1.- Definición y Propiedades generales de los virus. 3.2.- Estructura general de los virus. 3.2.1.- Tamaño. 3.2.2.- Genoma. 3.2.3.- Cápsida. 3.2.4.- Nucleocápsida. 3.2.5.- Estructuras no presentes en todos los virus. 3.2.5.1.- Cubierta o envoltura. 3.2.5.2.- Enzimas 3.3.- Replicación de los virus. Etapas. 3.3.1.- Adherencia o fijación a la célula diana. 3.3.2.- Penetración. 3.3.3.- Obtención de ARNm vírico. 3.3.4.- Síntesis de proteínas tempranas. 3.3.5.- Replicación del genoma del virus 3.3.6.- Síntesis de proteínas tardías 3.4.- Principios de taxonomía de virus. TEMA 4. VIRUS BACTERIANOS (BACTERIOFAGOS). 4.1.- Características y Estructuras típicas de los bacteriófagos. 4.2.- Etapas de la infección de los bacteriófagos. 4.2.1.- Adsorción del virus a la célula diana. 4.2.2.- Penetración del genoma del fago. 4.2.3.- Producción de proteínas y copias del genoma del fago. 4.2.4.- Ensamblaje 4.2.5.- Lisis de la bacteria y liberación de la nueva progenie de virus. 4.3.- Descripción de los bacteriófagos más representativos. 4.3.1.- Mapa genético y replicación de MS2. 4.3.2.- Mapa genético y replicación de fX174. 4.3.3.- Mapa genético y replicación de M13. 4.3.4.- Eventos durante el ciclo vírico infectivo del fago T4. 4.3.5.- Conceptos en la lisogenia. 4.3.6.- Regulación genética. Ciclo lítico en el bacteriófago l. 4.3.7.-Integración del genoma de l en el cromosoma de Escherichia coli. 4.3.8.-Genoma e integración del fago m. 4.4.- Bacteriófagos de Archaeas. * TEMA 5. VIRUS EUCARIOTAS. 5.1.- Características y estructura general de los virus de vertebrados 5.1.2.- Etapas en la infección vírica. 5.1.2.1.- Adsorción del virus a la célula diana. 5.1.2.2.- Penetración y descapsidación. 5.1.2.3.- Obtención de ARNm vírico en la célula hospedadora 5.1.2.4.- Salida del virus de la célula hospedadora y adquisición de la envoltura. 5.1.3.- PRINCIPALES GRUPOS DE VIRUS ANIMALES 5.1.3.1.- Virus con genoma ARN. 5.1.3.1.1.- Virus ARN mc 5.1.3.1.1.1.- ARN mc (+) Picornavirus y Retrovirus. 5.1.3.1.1.2.- ARN mc (-): Ortomixovirus; Rabdovirus; 5.1.3.1.2.- Virus ARN bc; Reovirus 5.1.3.2.- Virus con genoma ADN. 5.1.3.2.1.- AND mc; parvovirus 5.1.3.2.2.- ADN bc: Hepadnavirus (hepatitis B), Papovavirus; Herpesvirus; Poxvirus; Adenovirus. 5.1.4.- Clasificación de los virus animales. 5.1.4.1.- Virus con genoma ARN. 5.1.4.2.- Virus con genoma ADN. 5.1.5.- AGENTES ANTIVIRALES. 5.1.5.1.- Nucleósidos. 5.1.5.1.1.- Aciclovir. 5.1.5.1.2.- Ribavirina. 5.1.5.1.3.- Ganciclovir. 5.1.5.1.4.- Cidofovir. 5.1.5.2.- Inhibidores de proteasas víricas. 5.1.5.2.1.- Nucleosídicos. 5.1.5.2.2.- No Nucleosídicos. 5.1.5.3.- Inhibidores nucleósidos de transcriptasa inversa (INTI). 5.1.5.4.- Inhibidores de la neuraminidasa. 5.1.5.5.- Otros 5.1.6.- RESISTENCIAS A ANTIVIRALES. 5.2. VIRUS DE INSECTOS 5.3.- VIRUS DE PLANTAS 5.4.- VIRUS Y CÁNCER II BACTERIOLOGÍA II.I. MORFOLOGÍA Y ESTRUCTURA DE LAS BACTERIAS TEMA 6. TAMAÑO Y FORMA DE LAS BACTERIAS. CÁPSULA. 6.1.- Tamaño de las bacterias. 6.1.1.- Propiedades bacterianas asociadas a su tamaño. 6.1.2.- Nanobacterias. 6.2.- Morfología bacteriana. 6.3.- Estructura de la célula bacteriana. 6.4.- Polímeros extracelulares: Glicocalix (cápsula y capas mucosas externas) y Capa S 6.4.1.-Glicocalix 6.4.1.1.- Composición Química 6.4.1.2.- Observación 6.4.1.3.- Biosíntesis 6.4.1.4.- Funciones 6.4.2.- Capa S TEMA 7.- PARED BACTERIANA. 7.2.- Tipos de Pared Celular. 7.2.1.- Pared celular de las bacterias Gram positivas. 7.2.1.1.- Péptidoglicano. 7.2.1.2.- Otros componentes. 7.2.1.2.1.- Ácidos teicoicos. 7.2.1.2.2.- Ácidos lipoteicoicos. 7.2.1.2.3.- Proteínas de la Pared. 7.2.1.2.3.1.- Exoenzimas. 7.2.1.2.3.2.- Proteínas de superficie. 7.2.1.2.4.- Lípidos. 7.2.1.3.- Características de la Pared celular de bacterias Gram positivas. 7.2.2.- Pared celular de las bacterias Gram negativas. 7.2.2.1.- Péptidoglicano. 7.2.2.2.- Membrana Externa. 7.2.2.2.1.- Proteínas. 7.2.2.2.1.1.- Lipoproteína de Braun. 7.2.2.2.1.2.- Porinas. 7.2.2.2.2.- Lipopolisacárido. 7.2.2.2.2.1.- Lípido A. 7.2.2.2.2.2.- Cadena R. 7.2.2.2.2.3.- Cadena lateral. 7.2.2.2.2.4.- Función del LPS. 7.3.- Función de la Pared celular bacteriana. 7.4.- Diferencias en la Pared Celular de bacterias Gram (+) y Gram (-). 7.5.- La pared celular en las Arqueobacterias. 7.6.- Crecimiento de la pared celular. 7.7.- SISTEMAS DE SECRECIÓN DE PROTEÍNAS. 7.7.1.-Sistema dependiente de Sec. 7.7.2.- Sistemas de secreción en bacterias Gram (-). 7.8.- Formas bacterianas carentes de pared celular: Esferoplastos, Protoplastos y Formas L. TEMA 8.- MEMBRANA CITOPLASMÁTICA. 8.1.- Composición química. 8.1.1.- Proteínas. 8.1.2.- Lípidos. 8.2.- Lípidos de la Membrana de Arqueobacterias. 8.3.- Modelos de Membranas en Arqueas. 8.4.- Espacio periplasmático. 8.4.1.- Función de los enzimas del espacio periplasmático. 8.5.- Función de la Membrana citoplasmática. 8.5.- Estructuras asociadas a la Membrana citoplasmática. 8.5.1.- Mesosomas. 8.5.2.- Cromatóforos. TEMA 9.- PROTOPLASTO O CITOPLASMA BACTERIANO. 9.1.- Ribosomas. 9.1.1.-Diferencias con los de la célula eucariota. 9.1.2.- Función. 9.2.- Cromosoma. 9.2.1.- Composición química. 9.2.2.- Tamaño y estructura. 9.3.- Elementos genéticos extracromosómicos. 9.3.1.- Plásmidos. 9.3.3.1.- Características y obtención. 9.3.1.2.- Tipos de Plásmidos. 9.3.1.2.1.- Plásmidos compatibles. 9.3.1.3.- Curación. 9.3.1.4.- Características codificadas por plásmidos. 9.3.2.- Elementos genéticos transponibles. 9.3.2.1.- Secuencias de Inserción (IS). 9.3.2.2.- Transposones (Tn). 9.3.2.2.1.- Mecanismo de integración de transposones. 9.4.-INCLUSIONES Y ORGÁNULOS CITOPLASMÁTICOS. 9.4.1.- Inclusiones de reserva. 9.4.1.1.-Inclusiones de reserva de compuestos orgánicos. 9.4.1.1.1.-Gránulos de poli -  - hidroxibutírico (PHB). 9.4.1.1.2.- Inclusiones de polisacáridos. 9.4.1.1.3.-Inclusiones de Hidrocarburos. 9.4.1.1.4.- Gránulos de cianoficina. 9.4.1.2.-Inclusiones de reserva de compuestos inorgánicos. 9.4.1.2.1.- Gránulos de polifosfatos. (metalocromáticos, Volutina). 9.4.1.2.2.- Carboxisomas. 9.4.1.2.3.- Gránulos de azufre. 9.4.2.- Inclusiones y orgánulos no de reserva. 9.4.2.1.- Vesículas de gas. 9.4.2.2.- Inclusiones de sales minerales. 9.4.2.4.- Clorosomas. 9.4.2.5.-Magnetosomas. 9.4.2.6.- Tilacoides. TEMA 10.- APENDICES BACTERIANOS Y MOVIMIENTO. 10.1.- Flagelo. 10.1.1.- Estructura del flagelo. 10.1.1.1.- Filamento. 10.1.1.2.- Gancho o codo. 10.1.1.3.- Cuerpo o corpúsculo basal. 10.1.2.- Función y características del movimiento flagelar. 10.1.3.- Biosíntesis del flagelo. 10.2.- Taxias. 10.3.- Flagelos periplasmáticos. 10.4.- Movimiento deslizante. 10.5.- Otros apéndices bacterianos. 10.5.1.- Fimbrias o Pili. 10.5.2- Pelos sexuales. 10.5.3.- Prosteca. 10.5.4.- Tallos y pedúnculos. TEMA 11.- DIFERENCIACIÓN CELULAR. ESPORULACIÓN. 11.1.- Endospora bacteriana. 11.1.1.- Características generales. 11.1.1.2.- Estructura general de la endospora bacteriana. 11.1.1.2.1.- Protoplasto. 11.1.1.2.2.- Pared de la espora. 11.1.1.2.3.- Corteza. 11.1.1.2.4.- Pared de la espora. 11.1.1.2.6.- Corteza. 11.1.1.2.7.- Cubierta. 11.1.1.2.8.- Exosporio. 11.1.2.- Esporulación. 11.1.2.1.- Activación del proceso de esporulación. 11.1.2.2.- Sustancias de interés producidas durante la esporulación. 11.1.2.3.- Etapas de la esporulación. Género Bacillus. 11.1.3.- Propiedades biológicas de la espora. 11.1.4.- Germinación. 11.1.4.1.- Fase de Activación. 11.1.4.2.- Fase de Germinación. 11.1.4.3.- Crecimiento externo. 11.2.-Otras formas bacterianas originadas por diferenciación celular. 11.2.1.- Exosporas. 11.2.2.- Esporas de Actinomicetos. 11.2.3.- Quistes. 11.2.4.- Heteroquistes. 11.2.5.- Aquinetos. II.II. CRECIMIENTO BACTERIANO Y SU CONTROL TEMA 12.- NUTRICIÓN BACTERIANA.. 12.1.- Concepto de Nutrición. 12.2.- Clasificación de bacterias de acuerdo a la fuente de Carbono. 12.3.- Nutrientes universales. Agua. 12.4.- Factores de crecimiento. 12.5.- Concepto de Auxotrofía y Prototrofía. 12.5.- Transporte a través de la membrana citoplasmática. 12.5.1.- Transporte pasivo no específico o Difusión. 12.5.2.- Transporte pasivo específico o Transporte facilitado. 12.5.3.- Transporte activo. 12.5.3.1.- Transporte activo debido a proteínas periplasmáticas. 12.5.3.2.- Transporte activo asociado al trasiego de protones. 12.5.3.3.-Transporte por translocación de grupos. 12.5.4.- Captación de Hierro. 12.6.- CULTIVO in vitro DE LAS BACTERIAS. 12.6.1.- Medios de cultivo. 12.6.1.1.- Definición. 12.6.1.2.- Tipos de medios. 12.6.2.- Componente de los medios de cultivo. 12.6.2.1.- Agentes gelificantes. 12.6.2.2.- Nutrientes. 12.6.2.2.1.- Fuente de carbono. 12.6.2.2.2.- Fuente de proteínas y aminoácidos. 12.6.2.3.- Componentes inorgánicos. 12.6.2.3.1.- Sistemas amortiguadores del pH. 12.6.2.3.2.- Sales minerales. 12.6.2.3.3.- Compuestos utilizados en medios enriquecidos. 12.6.2.3.4.- Compuestos utilizados en medios selectivos. TEMA13.- METABOLISMO ENERGÉTICO BACTERIANO. 13.1.- Clasificación de los seres vivos según su forma de obtención de energía. 13.2.1.- Quimiotrofía. 13.2.1.1.- Fermentación. 13.2.1.1.1.- Principales fermentaciones bacterianas. 13.2.2.- Respiración bacteriana. 13.2.2.1. Aceptores de electrones en respiración bacteriana. 13.2.3.- Fotosíntesis bacteriana. 13.2.3.1.- Fotosíntesis acíclica. 13.2.3.2.- Fotosíntesis cíclica. TEMA 14.- CRECIMIENTO Y CULTIVO BACTERIANO. 14.1. - Definiciones. 14.2.- Procesos en la formación del septo de división bacteriana 14.3.- Ciclo celular bacteriano 14.4.- Crecimiento poblacional. 14.4.1.- Crecimiento sincrónico. 14.4.1.1.- Obtención de cultivos sincrónicos. 14.4.2.- Crecimiento balanceado o equilibrado. 14.4.3.- Crecimiento restringido y no restringido 14.4.4.- Cultivo continuo de microorganismos. Quimiostato y Turbidostato. 14.5.1.- Crecimiento poblacional bacteriano y su determinación. 14.5.1.1.- Determinación del número de bacterias. 14.5.1.1.1.- Métodos directos. Cámaras de recuento celular (Petroff-Hausser). 14.5.1.1.2.- Métodos indirectos. 14.5.1.1.2.1.- Recuento de colonias (UFC). 14.5.1.1.2.2.- Recuentos por filtración. 14.5.1.2.- Determinación de la masa bacteriana. 14.5.1.2.1.- Métodos directos.A.- Determinación del peso húmedo. Centrifugación. B.- Determinación del peso seco. C.- Determinación del Nitrógeno total (Kjendahl). D.- Determinación de un componente celular relacionado con el crecimiento de la población. 14.5.1.2.2.- Métodos indirectos (ópticos). 14.5.1.2.3.- Determinación de la Absorbancia (turbidez): Espectrofotometría. 14.5.1.2.4.- Determinación de la Luz reflejada: Nefelometría. 14.5.1.3.- Determinación de la actividad metabólica. 14.5.2.- Curva de crecimiento bacteriano. 14.5.2.1.- Curva de crecimiento bacteriano en sistemas cerrado. 14.5.2.1.1.- Fase de latencia. 14.5.2.1.2.- Fase exponencial de crecimiento. 14.5.2.1.3.- Fase estacionaria de crecimiento. 14.5.2.1.4. Fase de muerte. 14.5.2.1.5.- Crecimiento diauxico TEMA 15.- EFECTO DE AGENTES EXTERNOS SOBRE EL CRECIMIENTO BACTERIANO. 15.1.- Temperatura. 15.1.1.- Clasificación de las bacterias por temperatura de crecimiento. 15.1.2.- Mecanismos de adaptación de bacterias a hábitat con temperaturas extremas. 15.2.- pH. 15.3.- Presión osmótica. 15.3.1.- Bacterias halófilas. 15.3.1.1.- Mecanismo de adaptación. 15.3.2.- CONTROL DEL CRECIMIENTO BACTERIANO. 15.3.2.1. Definiciones. 15.3.2.2.- Efecto letal del calor y sus aplicaciones. 15.3.2.2.1.- Esterilización. 15.3.2.2.1.1.- Esterilización con calor húmedo (vapor de agua) 15.3.2.2.1.1.1.- Autoclave. 15.3.2.2.1.1.2.- Pasteurización. 15.3.2.2.1.1.3.- Otros tratamientos. 15.3.2.2.1.2.- Esterilización por calor seco. 15.3.15.3.2.2.1.3.- Controles en la esterilización por calor. 15.3.2.3.- Efecto de las bajas Temperaturas sobre el crecimiento bacteriano. 15.3.2.3.1.- Refrigeración. 15.3.2.3.2.- Congelación. 15.3.2.3.3.- Liofilización. 15.3.2.4.- Efecto de las radiaciones. 15.3.2.4.1.- Radiaciones ionizantes. 15.3.2.4.2.- Radiaciones electromagnéticas o no ionizantes. 15.3.2.4.2.1- Radiación ultravioleta. 15.3.2.4.2.2.- Luz visible. 15.3.2.4.2.2.1.- Sensibilización fotodinámica. 15.3.2.5.- Efecto de las ondas sonoras. 15.3.2.6.- Efecto de la presión hidrostática. 15.3.2.7.- Otras metodologías de esterilización. 15.3.2.7.1.- Filtración. 15.3.2.7.1.1.- Filtros en profundidad. 15.3.2.7.1.2.- Filtros de membrana. 15.3.2.7.1.3.- Nucleoporos. 15.3.2.7.1.4.- Filtros HEPA. 15.3.2.8.- Desinfectantes. 15.3.2.8.1.- Formaldehído. 15.3.2.8.2.- Glutaraldhehido. 15.3.2.8.3.- Hipoclorito sódico. 15.3.2.8.4.- Fenol. TEMA 16.- AGENTES ANTIBACTERIANOS DE UTILIZACIÓN CLÍNICA. I. ACCIÓN TÓPICA: ANTISÉPTICOS. 16.- Agentes antibacterianos. 16.1.- ANTISÉPTICOS. 16.1.1.- ACIDOS. 16.1.1.1.- Ácido acético. 16.1.1.2.- Ácido Bórico. 16.1.2.- ALCOHOLES. 16.1.2.1.- Alcohol isopropílico. 16.1.2.2.- Alcohol etílico. 16.1.3.- OXIDANTES. 16.1.3.1.- Permanganato potásico. 16.1.3.2.- Agua Oxigenada (Peróxido de Hidrógeno). 16.1.4.- HALOGENOS. 16.1.4.1.- Hipoclorito sódico. 16.1.4.2.- Cloramina (Tosilcloramina, Cloramina T). 16.1.4.3.- Yodo. 16.1.4.4.- Povidona iodada. 16.1.5.- IONES METALICOS. 16.1.5.1.- Merbromina Tiomersal. 16.1.5.2.- Nitrato de plata. 16.1.6.- FENOLES. 16.1.6.1.- Fenol y Cresoles. 16.1.6.2.- Hexaclorofeno. 16.1.6.3.- Triclosán. 16.1.7.- DETERGENTES CATIONICOS. 16.1.7.1.- Cloruro de benzalconio. Cloruro de benzetonio. 16.1.8.- COLORANTES. 16.1.8.1.- Metilrosanilina (Violeta de Genciana). 16.1.9.- OTROS. 16.1.9.1.- Clorhexidina. TEMA 17.- AGENTES ANTIBACTERIANOS DE UTILIZACIÓN CLÍNICA. II. ACCIÓN SISTÉMICA: ANTIBIÓTICOS Y QUIMIOTERÁPICOS DE SÍNTESIS Y ANTIMICÓTICOS. 17.1.- AGENTES ANTIBACTERIANOS QUE ACTÚAN SOBRE LA PARED BACTERIANA. 17.1.1.- Antibióticos beta – lactámicos. 17.1.1.1.- Penicilinas. 17.1.1.1.1.- Características generales. 17.1.1.1.2.- Tipos de penicilinas. 17.1.1.2.- Cefalosporinas. 17.1.1.2.1.- Principales cefalosporinas. 17.1.1.3.- Otros betalactámicos. 17.1.1.3.1.- Monobactámicos. 17.1.1.3.2.- Carbapénicos. 17.1.1.4.- Inhibidores de beta-lactamasas. 17.1.2.- Antibióticos Glicopéptidos. 17.1.3.- Fosfomicina. 17.1.4.- Bacitracina. 17.2.- AGENTES ANTIBACTERIANOS QUE ACTÚAN SOBRE LA MEMBRANA CITOPLASMÁTICA. 17.2.1.- Antibióticos polipeptidicos. Polimixinas. 17.3.- AGENTES ANTIBACTERIANOS QUE ACTÚAN SOBRE RIBOSOMA BACTERIANO 17.3.1.- SUBUNIDAD 30 S. 17.3.1.1.- Aminoglucósidos. 17.3.1.2.- Tetraciclinas. 17.3.1.3.- Macrólidos. 17.3.2.- SUBUNIDAD 50 S. 17.3.2.1.- Macrólidos y Ketólidos. 17.3.2.2.- Oxazolidinonas. 17.3.2.3.- Estreptograminas. 17.4.- AGENTES ANTIBACTERIANOS QUE ACTÚAN SOBRE LA SÍNTESIS DE ÁCIDOS NUCLÉICOS. 17.4.1.- Rifampicinas. 17.4.2.- Quinolonas. 17.4.3.- Análogos estructurales del P.A.B.A: Sulfamidas. PAS, Sulfonas, 17.4.4.- Trimetoprim y Metronidazol. 17.5.- RESISTENCIA BACTERIANA A FÁRMACOS ANTIBACTERIANOS. 17.5.1.- Definición. 17.5.2.- Tipos. 17.5.2.1.- Natural o intrínsica. 17.5.2.2.- Adquirida. 17.5.2.2.1.- Mecanismos de adquisición. 17.5.3.- Multirresistencia. 17.5.4.-Terapia antibacteriana. Consideraciones generales. 17.5.5.- Superinfecciones. 17.5.- AGENTES ANTIMICÓTICOS. 17.5.1.- Mecanismos de acción. 17.5.2.- Antimicóticos para micosis superficiales. 17.5.3.- Antimicóticos para micosis profundas II.III. GENÉTICA TEMA 18.- GENÉTICA BACTERIANA. 18.1.- Variaciones bacterianas Tipos. 18.2.- Variaciones genotípicas No asociadas a intercambio de información genética. 18.2.1.- Mutaciones. 18.2.1.- Agentes mutagénicos. 18.2.1.2.- Mecanismos de reparación del ADN. 18.2.1.2.1.- Reparación por escisión. 18.2.1.2.3.- Mecanismo de reparación SOS. 18.2.1.3.- Reversión de mutaciones. 18.2.1.3.1.- Directas. 18.2.1.3.2.- Indirectas.18.2.2.- Test de la complementación TEMA 19.- TRANSFERENCIA DE MATERIAL GENÉTICO ENTRE BACTERIAS 19.1.-TRANSFORMACIÓN. 19.1.1.- Transformación en Bacterias Gram (+). 19.1.1.1.- Factor Activador de la Competencia (FAC). 19.1.1.2.- Entrada del ADN a la bacteria receptora. 19.1.1.3.-Integración ADN. 19.1.2.- Transformación en bacterias Gram (-), Haemophilus. 19.1.3.1.-Transfección. 19.1.3.2.- Transformación por Plásmidos. 19.2.- CONJUGACIÓN BACTERIANA. 19.2.1.- Bacterias F- y F+. 19.2.2.- Conjugación en bacterias Gram (-). 19.2.2.1.- Formación de agregados inestables. 19.2.2.2.- Estabilización del cruce. 19.2.2.3.- Transferencia de material genético. 19.2.2.4.- Desagregación activa. 19.2.3.- Bacterias Hfr. 19.2.3.1.- Zigosis letal. 19.2.4.- Conjugación en bacterias Gram (+). 19.2.5.- Sexducción. 19.3.-TRANSDUCCIÓN. 19.3.1.- Transducción generalizada. 19.3.2.- Transducción específica. 19.3.3.- Transducción abortiva. II. IV.- TAXONOMÍA BACTERIANA TEMA 20.- TAXONOMÍA BACTERIANA 20.1.- Definiciones. 20.2.- Tipos de clasificación en bacterias. 20.2.1.- Fenética. 20.2.2.- Numérica. 20.2.3.- Filogenética. 20.3.- Características utilizadas en taxonomía. 20.3.1.- Clásicas. 20.3.2.- Moleculares. 20.4.- Nomenclatura bacteriana: binomial. 20.5.- Manuales de taxonomía bacteriana. 20.5.1.- The Prokaryotes. 20.5.2.- Bergey´s Manual of Systematic Bacteriology. TEMA 21.- DOMINIO ARCHAEA (Arqueobacterias). 21.1.- Características generales. Pared, membrana, genética y metabolismo. 21.2.- Dominio Archaea. Taxonomía. 21.2.1.- Phylum AI. Crenarchaeota. Taxonomía. 21.2.1.2.- Géneros más representativos del reino Crenarchaeota. 21.2.1.1.- Características generales de Phylum AI (Reino) Crenarchaeota. 21.2.2.- Phylum AII. Euryarchaeota. Taxonomía. 19.2.2.1.- Características generales. 21.2.2.2.- Archaeas halófilas. 21.2.2.2.1.- Características generales. 21.2.2.3.- Termoplasmas. Taxonomía. 21.2.2.3.1. Características generales. 21.2.2.4. Termococos. Taxonomía. 21.2.2.4.1.- Características generales. TEMA 22.- EUBACTERIAS TERMÓFILAS. 22.1.- Phylum BI. Aquificae. 22.2.- Phylum BII. Thermothogae. 22.3.- Phylum BIII. Thermodesulfobacteria. 22.4.- Phylum B IV. Deinococous-Thermus. 22.4.1.- Deinococos. Características generales. 22.4.1.1.- Diferencias de Deinococos con otras bacterias. 22.4.2.- Género Thermus. 22.5.- Phylum B V. Chrysiogenetes. 22.5.- Bacterias filamentosos fototrofas anoxigénicas. 22.5.1.- Bacterias verdes no del azufre. Orden I. Chloroflexales. 22.6.- Phylum VIII. Nitrospirae. TEMA 23.- CIANOBACTERIAS Y CHOROBI. 23.1. Phylum BX. Bacterias fotosintéticas oxigénicas (Cianobacterias). 23.1.1.- Características generales. 23.1.2.- Taxonomía. 23.2.-Phylum BXI. Chlorobi. Bacterias verdes del Azufre 23.2.1.- Características generales. TEMA 24.- CLASE I. ALFA-PROTEOBACTERIAS. 24.1.- Orden I. Rhodospirillaceales. 24.1.1.- Fam. I. Rhodospirillaceae. [Bacterias Purpúreas (Rojas) No del Azufre]. 24.1.1.1.-Características generales. 24.1.1.2.- Géneros: Rhodospirilum, Rhodovibrio. 24.1.2.- Fam. II. Acetobacteraceae. 24.2.- Orden II. Rickettsiales. 24.2.1.- Fam. I. Rickettsiaceae. 24.2.2.- Fam. II. Ehrlichiaceae. 24.3.- Orden IV. Sphingomonadales. 24.4.- Orden V. Caulobacterales. 24.5.- Orden VI. Rhizobiales. 24.5.1.- Fam. I. Rhizobiaceae. 24.5.2.- Fam. II. Bartonellaceae. 24.5.3.- Fam. III. Brucellaceae. 24.5.4.- Fam. VII. Bradyrhizobiaceae 24.5.5.- Fam. VIII. Hyphomicrobiaceae. TEMA 25.- CLASE II. BETA-PROTEOBACTERIA. 25.1.- Orden. I. Burkholderiales. 25.1.1.- Fam. I. Burkholderiaceae. 25.1.2.- Fam. IV. Alcaligenaceae. 25.1.2.1.- Género Alcalígenes. 25.1.2.2.- Género Bordetella. 25.1.3.- Fam. V. Comamonadaceae. 25.2.- Orden II. Hydrogenophilales. 25.2.1.- Fam. I. Hydrogenophilaceae. 25.3.- Orden IV. Neisseriales. 25.3.1.- Fam. I.- Neisseriaceae. 25.3.1.1.- Gen. Neisseria. 25.3.1.1.1.- N. gonorrhoeae. (gonococo). 25.3.1.1.2.- N. meningitidis (meningococo). 25.3.1.2.- Géneros Aquaspirillum y Chromobacterium. 25.4.- Orden V. Nitrosomonadales. 25.4.1.- Fam. I. Nitrosomonadaceae. 25.4.2.- Fam. II. Spirillaceae. 25.4.3.- Fam. III. Gallionellaceae. TEMA 26.- CLASE III. GAMMA-PROTEOBACTERIA 26.1.- Orden. I. Chromatiales 26.1.1.- Fam. I. Chromatiaceae [Bacterias Purpúreas (Rojas) del Azufre]. 26.1.2.- Fam. II. Ectothiorhodospiraceae 26.2.- Orden II. Xanthomonadales. 26.2.1.- Fam. I. Xanthomonadaceae 26.3.- Orden III. Fam. I. Cardiobacteraceae. 26.4.- Orden IV. Thiotrichales. 26.4.1.-Género Beggiatoa. 26.4.2.- Género Thiotrix. 26.4.3.- Género Leucothrix. 26.5.- Orden V. Legionellales. 26.5.1.- Fam. I. Legionellaceae. 26.5.2.- Fam. II. Coxiellaceae. 26.5.2.1.- Género Coxiella. 26.6.- Orden VI. Methylococcales. 26.7.- Orden. VIII. Pseudomonadales. 26.7.1.- Fam. I. Pseudomonadaceae. 26.7.1.1.- Gen. Pseudomonas. 26.7.1.2.- Género Azotobacter. 26.7.2.- Fam II. Moraxellaceae. 26.7.2.1.- Gen. Moraxella. 26.7.2.2.- Gen. Acinetobacter. 26.8. Orden X. Vibrionales. Fam. I. Vibrionaceae. 26.8.1.- Gen. Vibrio 26.8.2.- Gen. Photobacterium. 26.9.- Orden XI. Enterobacteriales. Fam. Enterobacteriaceae 26.9.1.- Características generales. 26.9.2.- Gen. Escherichia. 26.9.3.- Gen. Shigella. 26.9.4.- Gen. Salmonella. 26.9.5.- Gen. Klebsiella. 26.9.6.- Gen. Enterobacter. 26.9.7.- Gen. Citrobacter. 26.9.8.- Gen. Serratia. 26.9.9.- Gen. Proteus. 26.9.10.- Gen. Yersinia. 26.9.11.- Gen. Calymmatobacterium. 26.9.12.- Gen. Erwinia. 26.10.- Orden XII. Pasteurellales. 26.10.1.- Gen. Pasteurella. 26.10.2.- Gen. Haemophilus. 26.10.2.1.- H. Influenzae. 26.10.2.2.- H. ducreyi. TEMA 27.- CLASE IV. DELTA-PROTEOBACTERIA Y CLASE V. EPSILON- PROTEOBACTERIA 27.1.- Bacterias reductoras del Azufre y Sulfatos (Ordenes: Desulfurellales, 27.2.- Orden VI. Bdellovibrionales. Fam. Bdellovibronaceae. 27.3.- Orden VII. Myxococcales. 27.3.1.- Ciclo celular. 27.4.- Clase V. Epsilon-proteobacteria. 27.4.1.- Orden I. Campylobacterales. 22.4.1.1.- Fam. I. Campylobacteraceae. 27.4.1.2.- Fam II. Helicobacteraceae. TEMA 28.- PHYLUM BXIII. FIRMICUTES CON BAJO CONTENIDO EN G+C 28.1.- Clase Clostridia. 28.1.1.- Orden I. Clostridiales. Fam. I. Clostridiaceae. Gen. Clostridium. 28.1.1.1.- Características generales. 28.1.1.2.- C. tetani. 28.1.1.2.1.- Patogenia. 28.1.1.3.- C. botulinum. 28.1.1.4.- C. difficile. 28.1.1.5.- C. perfringens. 28.1.2.- Otras familias. 28.2.- Clase II. Mollicutes. 28.2.1.- Orden I. Mycoplasmatales. 28.2.1.1.- Fam. I. Mycoplasmataceae. 28.2.2.- Orden II. Entomoplasmatales. 28.2.2.1.- Fam. I. Entomoplasmataceae. 28.2.2.2.- Fam.II. Spiroplasmataceae. 28.3.- Clase III Bacilli. 28.3.1.- Orden I. Bacillales. 28.3.1.1.- Fam. Bacillaceae. 28.3.1.1.1.- Gen. Bacillus. 28.3.1.2.- Fam. II. Caryophanaceae. 28.3.1.3.- Fam. III. Listeraceae. 28.3.1.4.- Fam. IV. Staphylococcaceae. 28.3.1.4.1.- Gen. Staphylococcus. 28.3.2.- Orden II. Lactobacillales 28.3.2.1.- Fam. Lactobacillaleaceae 28.3.2.1.1.- Gen. Lactobacillus 28.3.2.2.- Fam. II. Enterococcaceae. 28.3.2.3.- Fam. III. Leuconostocaceae. 28.3.2.4.- Fam IV. Streptococcaceae. 28.3.2.4.1.- Gen. Streptococcus. 28.3.2.4.4.1.1.- Grupo hemolítico o Piogénico. 28.3.2.4.1.1.1.- S. pyogenes. 28.3.2.4.1.1.2.- S. pneumoniae. 28.3.2.4.1.1.3.- S. agalactiae. 28.3.2.4.1.2.- Grupo de estreptococos orales. 28.3.2.4.2.- Género Lactococus. 28.4.- Familia de inclusión incierta. Fam. Erysipelotricheae. Gen. Erysipelothrix. TEMA 29.- ACTINOBACTERIA. 29.1.- Orden I. Actinomycetales. 29.1.1.- Suborden I. Actinomycineae. Características generales. 29.1.1.1.- Fam. I. Actinomycetaceae. 29.1.2.- Suborden Micrococcineae. 29.1.2.1.- Fam. Micrococcaceae. 29.1.2.2.- Fam. Cellulomanadaceae. 29.1.2.3.- Fam. Dermatophilaceae. 29.1.3.- Suborden. Corynebacterineae. 29.1.3.1.- Fam. Corynebacteraceae. 29.1.3.1.1.- Gen. Corynebacterium. 29.1.3.2.- Fam II. Mycobacteraceae. 29.1.3.2.1.- Gen. Mycobacterium. 29.1.3.2.1.1.- M. tuberculosis. 29.1.3.2.1.2.- Micobacterias atípicas. 29.1.3.2.1.3.- M. leprae. 29.1.3.3.- Fam. III. Norcardiaceae. 29.1.4.- Suborden IV. Micromonosporineae. 29.1.4.1.- Fam. I. Micromonosporinaceae. 29.1.5.- Suborden V. Propionibacterineae. 29.1.5.1.- Fam. I. Propionibacteraceae. 29.1.6.- Suborden VI. Streptomycineae. 29.1.6.1.- Fam. I. Streptomycetaceae 29.1.7.- Suborden VII. Streptosporangineae. 29.1.7.1.- Fam. II. Thermomonosporaceae. 29.1.8.- Suborden VIII. Frankineae. 29.1.8.- Fam. I. Frankiaceae. 29.2.- Orden II. Bifidobacteriales. 29.2.1.- Fam. Bifidobacteriaceae. TEMA 30.- PLANCTOMICETOS CLAMIDEAS Y ESPIROQUETAS 30.1.- Phylum BXV. Planctomicetes. 30.2.- Phylum BXVI. Clamydiae. 30.2.1.- Gen. Chlamydia. 30.3.- Phylum BXVII Spirochaetes. 30.3.1.- Características generales. 30.3.2.- Familia I. Spirochaetaceae. 30.3.2.1.- Géneros patógenos: Treponema. 30.3.2.2.- Gen. Borrelia 30.3.3.- Familia II. Leptospiraceae. Género Leptospira. TEMA 31.- BACTEROIDES Y FUSOBACTERIAS. 31.1.- Phylum XX. Bacteroides. 31.1.1.- Gen. Bacteroides. 31.2.- Phylum XXI. Fusobacterias. 31.2.1.- Gen. Fusobacterium. 31.2.2.- Gen. Streptobacillus. PROGRAMAS DE SEMINARIOS Y PRÁCTICAS DE LABORATORIO I.- INTRODUCCIÓN AL TRABAJO EN EL LABORATORIO DE MICROBIOLOGÍA. 1.- NORMAS BÁSICAS DE SEGURIDAD EN EL LABORATORIO DE MICROBIOLOGIA. 1.1.- Antecedentes históricos. 1.2.- PRINCIPALES VÍAS DE INFECCIÓN EN EL LABORATORIO. 1.2.1.- Inhalación. 1.2.2.- Ingestión. 1.2.3.- Inoculación. 1.2.4.- Penetración por vía cutánea o mucosas. 1.3.- CLASIFICACIÓN DE LOS AGENTES BIOLÓGICOS EN FUNCIÓN DEL RIESGO DE INFECCIÓN. 1.3.1.- LABORATORIOS DE BAJO NIVEL DE CONTENCIÓN BIOLÓGICA. 1.3.1.1.- AGENTES BIOLÓGICOS: Grupo 1. 1.3.1.1.1.- Recomendaciones para trabajos con agentes biológicos del grupo 1. 1.3.1.1.2.-Prácticas especiales. 1.3.1.1.3.-Equipo de seguridad. 1.3.1.1.4.-Instalaciones. 1.3.1.2.-AGENTES BIOLÓGICOS: Grupo 2. 1.3.1.2.1.-Recomendaciones para trabajos con agentes biológicos del grupo 2. 1.3.1.2.2.- Prácticas especiales. 1.3.1.2.3.- Equipos de seguridad. 1.3.1.2.4.- Instalaciones. 1.4.- LABORATORIOS DE ALTO NIVEL DE CONTENCIÓN BIOLÓGICA. 1.4.1.- AGENTES BIOLÓGICOS: Grupo 3 1.4.1.1.- Laboratorio de nivel de contención biológica de nivel 3. 1.4.1.1.1.- Prácticas especiales. 1.4.1.1.2.- Equipo de seguridad. 1.4.1.1.3.- Instalaciones. 1.4.2.- AGENTES BIOLÓGICOS: Grupo 4. 1.4.2.1- Laboratorio de nivel de contención biológica de nivel 4. 1.4.2.1.1.-Prácticas especiales. 1.4.2.1.2.- Equipo de seguridad. 1.4.2.1.3.- Instalaciones. 1.5.- NIVELES DE CONTENCIÓN EN CULTIVOS CELULARES 2.- CONTROL DEL CRECIMIENTO MICROBIANO. 2.1. Definiciones. 2.2.- Efecto letal del calor y sus aplicaciones. 2.2.1.- Esterilización. 2.2.1.1.- Esterilización con calor húmedo (vapor de agua) 2.2.1.1.1.- Autoclave. 2.2.1.1.2.- Pasteurización. 2.2.1.1.3.- Otros tratamientos. 2.2.1.2.- Esterilización por calor seco. 2.2.1.3.- Controles en la esterilización por calor. 2.3.- Efecto de las bajas Temperaturas sobre el crecimiento bacteriano. 2.3.1.- Refrigeración. 2.3.2.- Congelación. 2.3.3.- Liofilización. 2.4.- Efecto de las radiaciones. 2.4.1.- Radiaciones ionizantes. 2.4.2.- Radiaciones electromagnéticas o no ionizantes. 2.4.2.1- Radiación ultravioleta. 2.4.2.2.- Luz visible. 2.4.2.2.1.- Sensibilización fotodinámica. 2.5.- Efecto de las ondas sonoras. 2.6.- Efecto de la presión hidrostática. 2.7.- Otras metodologías de esterilización. 2.7.1.- Filtración. 2.7.1.1.- Filtros en profundidad. 2.7.1.2.- Filtros de membrana. 2.7.1.3.- Nucleoporos. 2.7.1.4.- Filtros HEPA. 2.8.- Desinfectantes. 2.8.1.- Formaldehído. 2.8.2.- Glutaraldhehido. 2.8.3.- Hipoclorito sódico. 2.8.4.- Fenol. 2.8.5.- Cresol. II. VIROLOGÍA 3.1. TÉCNICAS USUALES EN VIROLOGÍA 3.1.- Cultivo de virus. 3.1.1.- Bacteriófagos o Fagos 3.1.2.- Virus animales 3.1.3.- Virus de plantas. 3.2.- Purificación de virus. 3.2.1.- Centrifugación diferencial. 3.2.2.- Precipitación: 3.2.3.- Desnaturalización: 3.2.4.- Digestión enzimática. 3.3.- Cuantificación de partículas víricas. III. BACTERIOLOGÍA 4.-CULTIVO in vitro DE LAS BACTERIAS. 4.1.- Medios de cultivo. 4.1.1.- Definición. 4.1.2.- Tipos de medios. 4.2.- Componente de los medios de cultivo. 4.2.1.- Agentes gelificantes. 4.2.2.- Nutrientes. 4.2.2.1.- Fuente de carbono. 4.2.2.2.- Fuente de proteínas y aminoácidos. 4.2.3.- Componentes inorgánicos. 4.2.3.1.- Sistemas amortiguadores del pH. 4.2.3.2.- Sales minerales. 4.2.3.3.- Compuestos utilizados en medios enriquecidos. 4.2.3.4.- Compuestos utilizados en medios selectivos. 4.3.- Preparación de los medios de cultivo. 5.- MICROSCOPIO 5.1.- Partes fundamentales del microscopio óptico. 5.1.1.- Condensador. 5.1.2.- Objetivos. 5.1.3.- Ocular. 5.2.- Tipos de microscopios. 5.2.1.- Microscopio de fondo claro. 5.2.2.- Microscopio de fondo oscuro. 5.2.3- Microscopio de contraste de fases. 5.2.4.- Microscopio de fluorescencia. 5.2.5.-Microscopio de contraste de interferencia diferencial. 5.2.6.- Microscopio de fuerza atómica. 5.2.7.- Microscopio confocal de barrido por laser. 5.2.8.- Microscopio electrónico. 5.2.8.1.- Microscopio de transmisión. 5.2.8.2.- Microscopio de barrido 6.-. OBSERVACIÓN DE PREPARACIONES BACTERIANAS 6.1.- Tipo de preparaciones. 6.1.1.- Preparaciones teñidas 6.1.1.1.- Tinciones para la observación de la morfología bacteriana. Tinción sencilla. 6.1.1.2.- Tinciones para el estudio de estructuras bacterianas. Tinción de esporas. Tinción de la cápsula bacteriana. 6.1.1.3.- Tinciones diferenciales. Tinción de Gram. Tinción de ácido-alcohol resistencia. (Ziehl- Neelsen). 6.1.2.- Preparaciones en fresco. Estudio de la movilidad bacteriana. 7.- AISLAMIENTO E IDENTIFICACIÓN BACTERIANA. 7.1.- Aislamiento bacteriano. 7.1.1.- Obtención de masa bacteriana. Análisis de la morfología y comportamiento tintorial de los aislamientos. 7.2.- Identificación de cocos Gram positivos. Pruebas de la oxidasa y de la catalasa. 7.3.- Identificación de bacilos Gram negativos. 7.3.1.- Diferenciación por la prueba de la oxidasa entre bacterias aerobias y enterobacterias. 7.3.1.1.- Diferenciación e identificación entre enterobacterias. Comportamiento en medio Kligler; pruebas del IMViC; fenilalanina desaminasa; y de la ureasa. 7.4.- Otras pruebas bioquímicas de interés. Hidrólisis del almidón (amilasa) y de la caseína. 8.- DETERMINACIÓN DEL CRECIMIENTO BACTERIANO. 8.1.- Crecimiento poblacional bacteriano y su determinación. 8.1.1.- Determinación del número de bacterias. 8.1.1.1.- Métodos directos. Cámaras de recuento celular (Petroff-Hausser). 8.1.1.2.- Métodos indirectos. 8.1.1.2.1.- Recuento de colonias (UFC). 8.1.1.2.2.- Recuentos por filtración. 8.1.2.- Determinación de la masa bacteriana. 8.1.2.1.- Métodos directos.A.- Determinación del peso húmedo. Centrifugación. B.- Determinación del peso seco. C.- Determinación del Nitrógeno total (Kjendahl). D.- Determinación de un componente celular relacionado con el crecimiento de la población. 8.1.2.2.- Métodos indirectos (ópticos). 8.1.2.3.- Determinación de la Absorbancia (turbidez): Espectrofotometría. 8.1.2.4.- Determinación de la Luz reflejada: Nefelometría. 8.1.3.- Determinación de la actividad metabólica. 9.- CURVA DE CRECIMIENTO BACTERIANO. 9.2.1.- Curva de crecimiento bacteriano en sistemas cerrado. 9.2.1.1.- Fase de latencia. 9.2.1.2.- Fase exponencial de crecimiento. 9.2.1.3.- Fase estacionaria de crecimiento. 9.2.1.4. Fase de muerte. 9.2.1.5.- Crecimiento diáuxico 10.- DETERMINACIÓN DE LA ACTIVIDAD ANTIBACTERIANA. 10.1.- Antibiograma.