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Denominación de la competencia |
| CB10 | Que los estudiantes posean las habilidades de aprendizaje que les permitan continuar estudiando de un modo que habrá de ser en gran medida autodirigido o autónomo. |
| CB6 | Poseer y comprender conocimientos que aporten una base u oportunidad de ser originales en el desarrollo y/o aplicación de ideas, a menudo en un contexto de investigación |
| CB7 | Que los estudiantes sepan aplicar los conocimientos adquiridos y su capacidad de resolución de problemas en entornos nuevos o poco conocidos dentro de contextos más amplios (o multidisciplinares) relacionados con su área de estudio |
| CB8 | Que los estudiantes sean capaces de integrar conocimientos y enfrentarse a la complejidad de formular juicios a partir de una información que, siendo incompleta o limitada, incluya reflexiones sobre las responsabilidades sociales y éticas vinculadas a la aplicación de sus conocimientos y juicios |
| CB9 | Que los estudiantes sepan comunicar sus conclusiones y los conocimientos y razones últimas que las sustentan a públicos especializados y no especializados de un modo claro y sin ambigüedades |
| CE2-1 | Conocer los fundamentos, técnicas y aplicaciones de la proteómica, genómica, bioinformática y biología de sistemas |
| CE2-2 | Adquirir las habilidades técnicas apropiadas en proteómica, genómica, bioinformática y biología de sistemas |
| CE2-3 | Conocer y manejar bases de datos y programas de bioinformática |
| CE2-4 | Realizar análisis de datos masivos 'ómicos' |
| CG1 | Manejar bibliografía y documentación científica en inglés |
| CG2 | Diseñar y planificar experimentos de investigación |
| CG3 | Ejecutar experimentos de investigación así como interpretar los resultados |
| CG4 | Diseñar estrategias experimentales alternativas |
| CG6 | Capacidad de crítica y argumentación así como de exposición escrita y oral de proyectos de investigación y sus resultados |
| CG7 | Saber utilizar y sacar el máximo rendimiento de las herramientas bioinformáticas, estadísticas y matemáticas |
| CT1 | Fomentar el respeto a los derechos fundamentales y de igualdad de oportunidades entre hombres y mujeres, los principios de igualdad de oportunidades y accesibilidad universal de las personas con discapacidad y los valores propios de una cultura de paz y valores democráticos. |
| CT2 | Desarrollar espíritu crítico y constructivo, con actitud positiva frente al conocimiento |
| CT3 | Demostrar capacidad de generación de nuevas ideas (creatividad) |
| CT4 | Desarrollar capacidad de trabajo en equipo, de líder, de diálogo, de crítica y autocrítica |
| CT5 | Espíritu innovador y emprendedor |
| CT6 | Motivación por la calidad |
| CT7 | Compromiso ético con personas, organismos públicos y/o privados y con el entorno interno y externo de las organizaciones |
| Resultados de aprendizaje | |
Resultado R3 |
Haber adquirido conocimientos avanzados en proteómica, genómica, bioinformática y biología de sistemas. |
Resultado R4 |
Haber adquirido habilidades para realizar técnicas de proteómica, genómica, bioinformática y biología de sistemas. |
Resultado R5 |
Ser capaz de manejar bases de datos, programas de bioinformática y realizar análisis de datos masivos. |
1. Fundamentos de proteómica: Plegamiento, transporte, recambio, maduración, degradación de proteínas e interacciones proteína-lingando.
2. Técnicas y métodos de preparación de muestra, separación (2-DE, HPLC-MS, otros), identificación y cuantificación en proteómica. Microarrays de proteínas. ProteoRed.
3. Aplicaciones de la espectrometría de masas en proteómica.
4. Aplicaciones de la proteómica en el diagnóstico, descubrimiento de medicamentos, agricultura, industria, etc.
5. Prácticas de Laboratorio. A) Realización en el laboratorio de una electroforesis bidimensional (2-DE) y su análisis posterior para estudiar el efecto del ayuno sobre el proteoma de hígado de rata. 5.1. Preparación de la muestra. 5.2. Isoelectroenfoque sobre tiras IPG. 5.3. Equilibrado de las tiras y preparación de la SDS-PAGE. 5.4. SDSPAGE. 5.5. Tinción y análisis de proteínas. Tinción con azul Coomasie y Sypro-Rubi. 5.6. Introducción a PDQuest R (BioRad Laboratories). 5.7. Métodos de análisis por espectrometría de masas de las manchas expresadasdiferencialmente. 5.8. Presentación de resultados. Identificación de proteínas y proteómica funcional. B) Métodos y equipos disponibles en la Universidad de Jaén para realización de estudios de proteómica. nLC-MS (Orbitrap).
6. Diseño computacional de fármacos.
7. Introducción a la genómica estructural: secuenciación de genomas completos, estructuras de los genomas de bacterias, hongos, plantas y animales.
8. Introducción a la genómica funcional: principales técnicas de medida de la expresión génica masiva y anotación funcional de genomas.
9. Bases de datos de Genética Molecular: 9.1. Nucleótidos: EMBL y Genbank con sus subdivisiones (dbGSS, dbSTS, dbSNP). 9.2. Proteínas: NCBI, Expasy, EMBL; estructura molecular de proteínas: NCBI, RELIBASE, 3Dee. 9.3. Bases de datos del proyecto genoma humano (centro Sanger), de proyectos de secuenciación de genomas completos (S. cerevisiae, B. subtilis, A. Thaliana, etc). 9.4. Bibliográficas (PubMed). 9.5. OMIM (On line Mendelian Inheritance in Man): enferemedades hereditarias humanas y sus mutaciones asociadas.
10. Obtención y análisis de secuencias de ADN y proteínas. 10.1. Secuenciación práctica de ADN en secuenciados automático; alineamiento y comparación de secuencias (BLAST, FASTA, CLUSTAL). 10.2. Análisis de secuencias de ADN (seqaid, DNAsis, GCG).
11. Otros programas informáticos en genética Molecular: 11.1. Búsqueda de genes, exones, y promotores (Genscan, BCM search launcher). 11.2. Cálculo de condiciones de PCR (oligo, Melting). 11.3. Cálculo de estructura secundaria del ARN (Fold). 11.4. Análisis de proteínas y motivos funcionales (EMBOSS, Prosite, Expasy). 11.5. Estudios de asociación genética de marcadores simples, haplotipos y Genome Wide.
12. Análisis de datos: Análisis de datos de expresión génica obtenidos por microarrays. Uso de R y NIHDAVID.
13. Integración de datos biológicos: estadística multivariante, y minería de datos.
14. Análisis, modelización y caracterización de la expresión génica: redes moleculares.
15. Biotecnología de sistemas: combinación de análisis in silico y ómicos en aplicaciones industriales.
16. Dinámica de sistemas biológicos: modelización y simulación
Técnicas y métodos de preparación de muestra, separación (2-D, HPLC- MS, otros), identificación y cuantificación en proteómica. Microarrays de proteínas. ProteoRed. Bases de datos y aplicaciones informáticas de genómica y proteómica. Entornos de programación en bioinformática: intérpretes de comandos. Análisis e integración de datos de "ómicas": agrupamiento, estadística multivariante y minería de datos. Modelización: redes moleculares y dinámica de sistemas.
M1 |
M1 Clases expositivas: Clases magistrales |
M2 |
M2 Clases expositivas: Exposición de teoría y ejemplos generales |
M4 |
M4 Clases expositivas: Conferencias |
M5 |
M5 Clases prácticas: Visitas técnicas |
M6 |
M6 Clases prácticas: Resolución de ejercicios/problemas |
M7 |
M7 Clases prácticas: Prácticas de laboratorio/campo/informática |
M9 |
M9 Clases prácticas: Seminarios/Debates |
M10 |
M10 Tutorías colectivas/individuales: Supervisión de trabajos dirigidos |
| ACTIVIDADES | HORAS PRESENCIALES | HORAS TRABAJO AUTÓNOMO | TOTAL HORAS | CRÉDITOS ECTS | COMPETENCIAS (códigos) |
|---|---|---|---|---|---|
| A1 - Clases expositivas en gran grupo | 20.0 | 0.0 | 20.0 | 0.8 |
|
| A2 - Clases en grupos de prácticas | 38.0 | 0.0 | 38.0 | 1.52 |
|
| A21 - Trabajo autónomo del alumno (estudio, lecturas, p.inf., ejerc., etc.) | 0.0 | 90.0 | 90.0 | 3.6 |
|
| A3 - Tutorías colectivas | 2.0 | 0.0 | 2.0 | 0.08 |
|
| TOTALES: | 60.0 | 90.0 | 150.0 | 6.0 |
Valoración de la asistencia. Hoja de firmas 5.0%
Valoración de la participación. Hojas de control de participación en clase y actividades. 5.0%
Valoración de los conocimientos sobre conceptos teóricos de la materia
Grado de adquisición de los conceptos teóricos. Pruebas de evaluación 20.0%
Valoración de la capacidad de realización de trabajos, casos o ejercicios. Capacidad de realización de
trabajos, casos o ejercicios. Exposición de trabajos, casos o ejercicios 15.0%
Valoración de la destreza en la realización de prácticas de laboratorio/campo/informática.
Destreza en la realización de prácticas de laboratorio/campo/informática.
Observación por parte del profesor y memoria escrita de prácticas o clases de informática 45.0%
Valoración de la capacidad de realizar presentaciones/ exposiciones/seminarios/debates
Valoración de la capacidad de realizar presentaciones/exposiciones/seminarios/ debates
Seminarios 10.0%
El sistema de calificación se regirá por lo establecido en el RD 1125/2003 de 5 de septiembre por el que se establece el sistema europeo de créditos y el sistema de calificaciones en la titulaciones universitarias de carácter oficial.
La calificación final de la asignatura se obtendrá al sumar las puntuaciones ponderadas obtenidas en cada aspecto de la asignatura. Si la asignatura no se aprueba en su conjunto en la convocatoria Ordinaria I, se guardará la nota de las partes superadas para la convocatoria Extraordinaria II. Para el caso de la convocatoria Extraordinaria II la calificación de la asistencia y/o participación en actividades presenciales y/o virtuales se podrá sustituir por la realización de una prueba de evaluación escrita.
S1 Valoración de la asistencia |
5.0 - 15.0 |
|
S2 Valoración de la participación |
5.0 - 15.0 |
|
S3 Valoración de los conocimientos sobre conceptos teóricos de la materia |
0.0 - 50.0 |
|
S4 Valoración de la capacidad de realización de trabajos, casos o ejercicios |
10.0 - 30.0 |
|
S5 Valoración de la destreza en la realización de prácticas de laboratorio/campo/informática |
10.0 - 50.0 |
|
S6 Valoración de la capacidad de realizar presentaciones/exposiciones/seminarios/debates |
10.0 - 40.0 |
- Principles Of Proteomics / . Autor: Twyman, Richard M.. Editorial: Garland Science,.
- Proteomics In Practice: A Guide To Successful Experimental Design . Autor: Wiley-VCH. Editorial: 9783527319411.
- Plant Proteomics: Technologies, Strategies, And Applications . Autor: John Wiley and Sons. Editorial: 9780470069769.
- Encyclopedia Of Genetics, Genomics, Proteomics And Informatics . Autor: Rédei, George P.. Editorial: Springer.
- Fundamentals Of Data Mining In Genomics And Proteomics . Autor: Springer. Editorial: 1-280-85254-2.
- Genomas. Autor: Brown, Terry A.. Editorial: Médica Panamericana.
- Methods Of Microarray Data Analysis Iv . Autor: Springer. Editorial: 9786610427505.
- Teoría Y Ejercicios Prácticos De Dinámica De Sistemas . Autor: Martín García, Juan.. Editorial: El autor.
- Manual De Proteómica. Autor: Sociedad Española de Proteómica, 2025.
- Dynamic Systems Biology Modeling And Simulation . Autor: Distefano, Joseph J.. Editorial: Elsevier, Academic Press.
- Genetics: Analysis Of Genes And Genomes . Autor: Hartl, Daniel L.. Editorial: Jones and Bartlett.
- Modern Multivariate Statistical Techniques: Regression, Classification, And Manifold Learning . Autor: Izenman, Alan Julian. Editorial: Springer,.
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