Universidad de Jaén

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Guía Docente
10211010-Bioinformática
Curso Académico 2025-26
FICHA IDENTIFICATIVA
Datos de la asignatura:
Código:
10211010
Nombre:
Bioinformática
Centro:
FACULTAD DE CIENCIAS EXPERIMENTALES
Titulación:
Grado en Biología
Curso:
1
Cuatrimestre:
SEGUNDO CUATRIMESTRE
Tipo:
Troncal / Básica
Idioma de impartición:
Español
Nivel PATIE:
-
Temporalidad:
Plataforma de teleformación:
Modalidad de impartición:
Presencial
Información adicional (PROF)
-




PROFESORADO

COORDINACIÓN
Nombre:
LORITE MARTÍNEZ, PEDRO
Departamento:
U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
Área:
420 - GENÉTICA
Categoría:
CATEDRATICO DE UNIVERSIDAD
Despacho:
90 - 359
Correo-e:
plorite@ujaen.es
Teléfono:
82769

EQUIPO DOCENTE
Nombre:
GARCÍA VICO, ÁNGEL MIGUEL
Departamento:
U118 - INFORMÁTICA
Área:
075 - CIENCIA DE LA COMPUTACIÓN E INT. ARTIFICIAL
Categoría:
TITULAR DE UNIVERSIDAD
Despacho:
A3 - A3-243
Correo-e:
agvico@ujaen.es
Teléfono:
953212802
ORCID:
-
URL web:
-
Nombre:
MORA RUIZ, PABLO
Departamento:
U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
Área:
420 - GENÉTICA
Categoría:
PERSONAL INVESTIGADOR
Despacho:
-
Correo-e:
-
Teléfono:
-
ORCID:
-
URL web:
-
Nombre:
SANTACRUZ ROCO, ÁLVARO
Departamento:
U103 - BIOLOGÍA EXPERIMENTAL
Área:
420 - GENÉTICA
Categoría:
PERSONAL INVESTIGADOR
Despacho:
B3 - 017
Correo-e:
asroco@ujaen.es
Teléfono:
953211745
ORCID:
-
URL web:
-




RESUMEN
Conocimientos previos y recomendaciones
No se requieren
Breve resumen de la asignatura (según memoria RUCT)
-
Prerrequisitos
-




COMPETENCIAS / RESULTADOS DEL PROCESO DE FORMACIÓN Y APRENDIZAJE
  COMPETENCIAS
CE10 Ser capaz de utilizar aplicaciones informáticas para el estudio de biomoléculas
CE41 Ser capaz de utilizar programas informáticos de análisis de secuencias de ácidos nucleicos y proteínas
CE53 Realizar análisis filogenéticos
CT1 Adquirir capacidad de gestión de la información, análisis y síntesis
CT2 Adquirir capacidad de organización planificación y trabajo en grupo
CT3 Ser capaz de comunicarse correctamente de forma oral y escrita en la lengua materna
CT4 Conocer una lengua extranjera
CT5 Ser capaz de resolver problemas y aplicar conocimientos teóricos a la práctica
CT6 Desarrollar actitudes críticas basadas en el conocimiento
CT7 Ser capaz de realizar aprendizaje autónomo para el desarrollo continuo profesional
CT8 Ser capaz de adaptarse a nuevas situaciones y de tomar decisiones
CT9 Tener sensibilidad hacia temas de índole social y medioambiental
CT10 Formar profesionales con sólidos valores éticos relacionados con los derechos fundamentales del ser humano, y de modo destacado los relacionados con la igualdad y no discriminación entre seres humanos.
  RESULTADOS
  Desarrollar habilidades relacionadas con las nuevas tecnologías digitales y su integración en el ejercicio profesional.
  Ser capaz de realizar búsquedas avanzadas en las diferentes bases de datos biológicas públicas.
  Desarrollar criterios de decisión para seleccionar aplicaciones bioinformáticas para resolución de diferentes tipos de problemas.
  Saber seleccionar aplicaciones bioinformáticas para resolver diferentes tipos de problemas.




DESCRIPCIÓN DE CONTENIDOS
Teoría

Unidad 1 - Bioinformática: consideraciones generales. Información en biología. La explosión de la información biológica. Definición de bioinformática. Vías de acceso a la información según la problemática.


Unidad 2 - Información biológica en formato electrónico. Aspectos computacionales básicos en bioinformática. La bioinformática y las bases de datos. Introducción a las bases de datos: características, acceso y principales herramientas de búsqueda. Formatos. Acceso a bases de datos web. Principales bases de datos biológicas.

Unidad 3 - Análisis de secuencias. Análisis de secuencias basado en aspectos composicionales. Búsqueda de patrones y motivos en secuencias. Estrategias básicas para la búsqueda de similitud entre secuencias. Comparación entre pares de secuencias y alineamientos múltiples. Búsqueda de secuencias similares en bases de datos: BLAST, FASTA.

Unidad 4 - Filogenias y árboles filogenéticos. Conceptos básicos de filogenia y evolución molecular. Filogenias basadas en datos morfológicos versus filogenias moleculares. Análisis filogenético basado en secuencias. Métodos de estimación de distancias evolutivas. Principales métodos para la construcción de árboles filogenéticos. Representación gráfica de árboles filogenéticos.

Unidad 5 - Dinámica de Sistemas en Biología. La dinámica de sistemas. El problema biológico y la definición del sistema. El diagrama causal. Creación y simulación del modelo. Aplicaciones en biología .

Unidad 6 - Análisis de imagen aplicado a la Biología. La imagen digital. Procesamiento y análisis de imagen. Manejo de información espacial y espectral en imágenes de interés biológico. Morfometría.

Práctica

Contenidos de prácticas y seminarios:
Bases de datos I
Bases de datos II
Bases de datos de ADN y proteínas
Análisis de secuencias I
Análisis de secuencias II
Filogenias moleculares
Dinámica de sistemas
Análisis de imágenes





METODOLOGÍAS DOCENTES Y ACTIVIDADES FORMATIVAS
Información adicional
-
Metodologías docentes
Código Descripción
M1 M1-Clases magistrales
M2 M2-Exposición de teoría y ejemplos generales
M6 M6- Actividades practicas
M10 M10-Aulas de informática
M11 M11-Resolución de ejercicios
M17 M17-Aclaración de dudas
Actividades formativas

El material docente estará disponible en la plataforma de docencia virtual de la universidad. Además, recibirá el apoyo tutorial por parte del equipo docente que le orientará personalmente para realizar su tarea de aprendizaje.

Clases expositivas : Presentación de la asignatura e introducción de bloques temáticos donde se aporta una visión global e integrada de las unidades que se van a estudiar dentro de cada bloque. Permiten adquirir las competencias: CE10, CE41, CE53, CG1, CT1, CT2, CT3, CT4, CT5, CT6, CT7, CT8, CT9.

Prácticas : Sesiones académicas teórico-prácticas, desarrolladas en el aula de informática, en las que el profesor explicará los contenidos de cada tema y el alumno, guiado por el profesor, irá utilizando las diferentes bases de datos y programas bioinformáticos. El estudiante posteriormente, en pequeño grupo o de forma autónoma, resolverá supuestos prácticos abordados en las clases. Permiten adquirir las competencias: CE10, CE41, CE53, CG1, CT2, CT3, CT4, CT5, CT6, CT7, CT8, CT9.

Seminarios : Sesiones desarrolladas en el aula con grupos reducidos de alumnos que permiten al estudiante ampliar el conocimiento de algunos de los aspectos tratados en el programa de la asignatura. Permiten adquirir las competencias: CG1, CT1, CT2, CT4, CT5, CT6, CT8, CT9.

Actividad

Horas Presencialidad
(%)
ECTS
A1-Clases expositivas en gran grupo 60 40 2.4
A2-Clases en pequeño grupo 90 40 3.6




SISTEMAS DE EVALUACIÓN
Sistemas de evaluación (específico)
ASPECTO CRITERIOS INSTRUMENTO PESO
Asistencia y/o participación en actividades presenciales y/o virtuales Asistencia y participación Control de asistencia y participación 0.0%
Conceptos teóricos de la materia Dominio de los conocimientos teóricos y operativos de la materia. Examen 25.0%
Realización de trabajos, casos o ejercicios Dominio en la resolución de problemas, casos prácticos y programas informáticos relacionados con la materia. Presentación de los trabajos y problemas propuestos en el aula de informática. 75.0%
El sistema de calificación se regirá por lo establecido en el RD 1125/2003 de 5 de septiembre por el que se establece el sistema europeo de créditos y el sistema de calificaciones en la titulaciones universitarias de carácter oficial
 
La evaluación será continua, y atenderá a varios niveles y distintos aspectos, considerándose:
Evaluación de las actividades prácticas . La asistencia a las sesiones prácticas en el aula de informática, así como la entrega de las actividades propuestas es OBLIGATORIA. NO SE PODRÁ FALTAR SIN CAUSA JUSTIFICADA A MÁS DE 2 SESIONES PRÁCTICAS O NO ENTREGAR MÁS DE 2 DE LAS ACTIVIDADES PROPUESTAS.  Se evaluarán las diferentes actividades propuestas para cada unidad temática. Se valorará la capacidad para aplicar los conocimientos teóricos adquiridos a situaciones prácticas concretas. Las actividades planteadas en las prácticas deberán ser entregadas a través de la plataforma de docencia online. La nota global de la evaluación de las actividades prácticas supone el 75% de la calificación de la asignatura. Permitirá evaluar las competencias: CE10, CE41, CE53, CG1, CT2, CT3, CT4, CT5, CT6, CT7, CT8, CT9.
 
Evaluación de los conceptos teóricos . Mediante exámenes escritos sobre los contenidos de teoría. Se evaluará el nivel de adquisición de los conceptos teóricos abordados en la asignatura. La nota del examen teórico supone el 25% de la calificación de la asignatura. Permitirá evaluar las competencias: CE10, CE41, CE53, CG1, CT1, CT2, CT3, CT4, CT5, CT6, CT7, CT8, CT9.
 
La nota final de la asignatura será la suma de la calificación de las actividades prácticas y el examen teórico. La realización del examen teórico es VOLUNTARIA, no siendo necesario hacerlo si la calificación final de las actividades prácticas multiplicada por 0.75 es igual o superior a 5.
 
Debido al carácter continuo de la evaluación de la asignatura en las convocatorias extraordinarias el alumnado se examinará de la totalidad de la asignatura, tanto de los contenidos teóricos como prácticos. El examen sobre conceptos teóricos será de forma similar al realizado en la convocatoria ordinaria. Igualmente se planteará la resolución de actividades prácticas en el aula de informática, que deberán ser entregadas una vez finalizada la prueba.
 
El peso de la evaluación de las actividades prácticas y el examen teórico será igual que en la convocatoria ordinaria (75% y 25%).
 
Tal y como se recoge en el "Reglamento de régimen académico y de evaluación del alumnado" en su artículo 18, "  Se considerará agotada una convocatoria cuando las pruebas de evaluación en las que el alumno o alumna  hubiera participado supongan en conjunto más del 30% de la calificación final de la asignatura ".
Sistemas de evaluación (general)
Aspecto Peso
S1-Asistencia y participación 0.0 - 10.0
S2-Conceptos teóricos de la materia 20.0 - 35.0
S3-Realización de trabajos, casos o ejercicios 65.0 - 80.0




BIBLIOGRAFÍA
Bibliografía
  1. Introduction To Bioinformatics . Autor: Lesk, Arthur M.. Editorial: Oxford University Press.


  2. Teori?A Y Ejercicios Pra?Cticos De Dina?Mica De Sistemas . Autor: Marti?n Garci?a, Juan. Editorial: El autor.


  3. Digital Image Processing . Autor: González, Rafael C.. Editorial: Pearson Education International.




OBJETIVOS DE DESARROLLO SOSTENIBLE
Objetivo 4: Educación de calidad.
Información adicional




CLÁUSULAS
Cláusula de protección de datos para grabación de clases

Responsable del tratamiento: Universidad de Jaén, Paraje Las Lagunillas, s/n; Tel.953 212121; www.ujaen.es

Delegado de Protección de Datos (DPO): TELEFÓNICA, S.A.U. ; Email: dpo@ujaen.es

Finalidad del tratamiento: Gestionar la adecuada grabación de las sesiones docentes con el objetivo de hacer posible la enseñanza en un escenario de docencia multimodal y/o no presencial.

Plazo de conservación: Las imágenes serán conservadas durante los plazos legalmente previstos en la normativa vigente.

Legitimación: Los datos son tratados en base al cumplimiento de obligaciones legales (Ley Orgánica 6/2001, de 21 de diciembre, de Universidades) y el consentimiento otorgado mediante la marcación de la casilla habilitada a tal efecto.

Destinatarios de los datos (cesiones o transferencias): Toda aquella persona que vaya a acceder a las diferentes modalidades de enseñanza.

Derechos: Ud. podrá ejercitar los derechos de Acceso, Rectificación, Cancelación, Portabilidad, Limitación del tratamiento, Supresión o, en su caso, Oposición. Para ejercitar los derechos deberá presentar un escrito en la dirección arriba señalada dirigido al Servicio de Información, Registro y Administración Electrónica de la Universidad de Jaén, o bien, mediante correo electrónico a la dirección de correo electrónico. Deberá especificar cuál de estos derechos solicita sea satisfecho y, a su vez, deberá acompañarse de la fotocopia del DNI o documento identificativo equivalente. En caso de que actuara mediante representante, legal o voluntario, deberá aportar también documento que acredite la representación y documento identificativo del mismo. Asimismo, en caso de considerar vulnerado su derecho a la protección de datos personales, podrá interponer una reclamación ante el Consejo de Transparencia y Protección de Datos de Andalucía www.ctpdandalucia.es

Cláusula de protección de datos para evaluación on-line

Responsable del tratamiento: Universidad de Jaén, Campus Las Lagunillas, s/n, 23071 Jaén

Delegado de Protección de Datos:dpo@ujaen.es

Finalidad: Conforme a la Ley de Universidades y demás legislación estatal y autonómica vigente, realizar los exámenes correspondientes a las asignaturas en las que el alumno o alumna se encuentre matriculado. Con el fin de evitar fraudes en la realización del mismo, el examen se realizará en la modalidad de video llamada, pudiendo el personal de la Universidad de Jaén contrastar la imagen de la persona que está realizando la prueba de evaluación con los archivos fotográficos del alumno en el momento de la matrícula. Igualmente, con la finalidad de dotar a la prueba de evaluación de contenido probatorio de cara a revisiones o impugnaciones de la misma, de acuerdo con la normativa vigente, la prueba de evaluación será grabada.

Legitimación: cumplimiento de obligaciones legales (Ley de Universidades) y demás normativa estatal y autonómica vigente.

Destinatarios: prestadores de servicios titulares de las plataformas en las que se realicen las pruebas con los que la Universidad de Jaén tiene suscritos los correspondientes contratos de acceso a datos.

Plazos de conservación: los establecidos en la normativa aplicable. En el supuesto en concreto de las grabaciones de los exámenes, mientras no estén cerradas las actas definitivas y la prueba de evaluación pueda ser revisada o impugnada.

Derechos: puede ejercitar sus derechos de acceso, rectificación, cancelación, oposición, supresión, limitación y portabilidad remitiendo un escrito a la dirección postal o electrónica indicada anteriormente. En el supuesto que considere que sus derechos han sido vulnerados, puede presentar una reclamación ante el Consejo de Transparencia y Protección de Datos de Andalucía www.ctpdandalucia.es